More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0165 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  69.39 
 
 		 252 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  73 
 
 		 251 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  70.37 
 
 		 269 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  72.02 
 
 		 248 aa  364  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  70.33 
 
 		 251 aa  358  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  74.78 
 
 		 253 aa  358  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  69.83 
 
 		 249 aa  358  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  69.01 
 
 		 249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  69.42 
 
 		 249 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.76 
 
 		 251 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.76 
 
 		 251 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.76 
 
 		 251 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.76 
 
 		 251 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  67.34 
 
 		 261 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  69.01 
 
 		 249 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  72.37 
 
 		 255 aa  345  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  65.25 
 
 		 251 aa  341  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  65.4 
 
 		 249 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.61 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  69.83 
 
 		 249 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  69.2 
 
 		 250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.82 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  63.64 
 
 		 250 aa  323  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.58 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.14 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.14 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.14 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.14 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.14 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.09 
 
 		 258 aa  314  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.78 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.09 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  64.56 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  60.08 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0522  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  73.68 
 
 		 256 aa  311  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  67.1 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.28 
 
 		 256 aa  308  6.999999999999999e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  57.71 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  61.92 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  56.73 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  56.73 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.66 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.66 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  55.87 
 
 		 266 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  57.66 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  55.06 
 
 		 266 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  58.87 
 
 		 368 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.09 
 
 		 398 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.58 
 
 		 262 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.58 
 
 		 262 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.18 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.94 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.26 
 
 		 368 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  54.69 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.58 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  56.96 
 
 		 250 aa  284  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  55.23 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  56.84 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  57.45 
 
 		 244 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  53.5 
 
 		 254 aa  281  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  56.07 
 
 		 265 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  53.56 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.44 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.44 
 
 		 253 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.44 
 
 		 253 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.01 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.08 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  50.64 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.63 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.66 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.58 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.17 
 
 		 263 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  47.83 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.09 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.39 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  46.96 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.39 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.77 
 
 		 262 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  47.77 
 
 		 262 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.77 
 
 		 262 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.02 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  47.98 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.57 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  46.47 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  45.53 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  48.29 
 
 		 262 aa  224  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  44.4 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.4 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2980  Sec-independent protein translocase TatC  49.19 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.64 
 
 		 277 aa  221  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>