More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2305 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  87.94 
 
 		 278 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0716  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  80.14 
 
 		 289 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206477 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.6 
 
 		 277 aa  358  6e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  53.81 
 
 		 255 aa  271  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.21 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  51.03 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  48.51 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  50.84 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  50.84 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  47.74 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.72 
 
 		 258 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.76 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.76 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  48.18 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  51.72 
 
 		 250 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  46.33 
 
 		 266 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  47.76 
 
 		 265 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.35 
 
 		 262 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  47.52 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  51.09 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.37 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.36 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  44.57 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.15 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.46 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  50.21 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.46 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  48.28 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  48.71 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.78 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.96 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.74 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  48.94 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.68 
 
 		 252 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.01 
 
 		 253 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.46 
 
 		 253 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  47.13 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  49.34 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.28 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  49.36 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  48.94 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.5 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.29 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.34 
 
 		 258 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.73 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.86 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.86 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.86 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.25 
 
 		 368 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.86 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.88 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.5 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.96 
 
 		 259 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.96 
 
 		 259 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.96 
 
 		 259 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.96 
 
 		 259 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  45.96 
 
 		 259 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  45.49 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  44.94 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  44.94 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.44 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.49 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  42.74 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  46.15 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  44.53 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  43.92 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  44.09 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  50 
 
 		 250 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  47.69 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  46.03 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  45.06 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  43.16 
 
 		 250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  48.12 
 
 		 250 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  43.29 
 
 		 244 aa  215  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.15 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  49.36 
 
 		 249 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.4 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  46.36 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  48.25 
 
 		 245 aa  208  8e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  43.48 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1055  Sec-independent protein translocase TatC  46.94 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.44 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1606  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.45 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.47 
 
 		 263 aa  205  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.39 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  43.48 
 
 		 263 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  40.68 
 
 		 259 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.23 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.23 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>