More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1606 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1606  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  79.67 
 
 		 263 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.05 
 
 		 262 aa  331  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  63.05 
 
 		 262 aa  331  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  64.66 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0816  Sec-independent protein translocase TatC  65.86 
 
 		 266 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.397111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0708  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.05 
 
 		 267 aa  315  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1055  Sec-independent protein translocase TatC  64.26 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.23 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  56.68 
 
 		 275 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5556  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.8 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.81 
 
 		 265 aa  255  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1182  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.62 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  51.21 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  54.94 
 
 		 266 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  52.48 
 
 		 244 aa  234  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  47.54 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.96 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.39 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  51.02 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.56 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.56 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.56 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.56 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.56 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  50.21 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  47.35 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  46.31 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.22 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  49.15 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.6 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.72 
 
 		 248 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  48.09 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.97 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  44.94 
 
 		 266 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.38 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  44.53 
 
 		 266 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.84 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.18 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  47.95 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.18 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  49.55 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.18 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  47.08 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  45.75 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.79 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.94 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  46.15 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.58 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.58 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  47.35 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  46.15 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.75 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.75 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.75 
 
 		 269 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.75 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.64 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.53 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.75 
 
 		 249 aa  214  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  49.37 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.37 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  44.94 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  45.9 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  46.67 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  45.9 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  46.34 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  48.33 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.09 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.56 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  47.56 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.56 
 
 		 262 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.18 
 
 		 267 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0371703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  51.52 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3217  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.18 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.920211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.86 
 
 		 263 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.86 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2980  Sec-independent protein translocase TatC  48.79 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  47.67 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.5 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3098  Sec-independent protein translocase TatC  50.2 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.923548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  49.36 
 
 		 262 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  48.79 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  48.79 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  48.79 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  48.79 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.16 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  48.79 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  48.79 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  48.79 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.86 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  47.19 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.86 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>