More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1182 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1182  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 272 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5556  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  77.69 
 
 		 274 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.09 
 
 		 262 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  55 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.49 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1055  Sec-independent protein translocase TatC  55.3 
 
 		 265 aa  288  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  53.7 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  52.55 
 
 		 263 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1606  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.4 
 
 		 249 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0708  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.92 
 
 		 267 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  50.19 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0816  Sec-independent protein translocase TatC  47.71 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.397111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.98 
 
 		 265 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  47.47 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  46.22 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.28 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.13 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  43.09 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.59 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.28 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.17 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  43.43 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.17 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  46.28 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  40.49 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.17 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.43 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.32 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.32 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.32 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.32 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.32 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.44 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  45.63 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  43.95 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  42.13 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.46 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.92 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  45.02 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  41.73 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.68 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  45.28 
 
 		 254 aa  198  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  42.11 
 
 		 244 aa  198  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.68 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  41.73 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  40.08 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.08 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.41 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  40.49 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  38.58 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  40 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.6 
 
 		 251 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.94 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.16 
 
 		 398 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.6 
 
 		 251 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  40.08 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.6 
 
 		 251 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  40.52 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.84 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.88 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.11 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  43.59 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.5 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  41.3 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.49 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  42.49 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.49 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.96 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  40.3 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.28 
 
 		 261 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  43.03 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.88 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.31 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.91 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  42.02 
 
 		 256 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  41.3 
 
 		 249 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.09 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.44 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  43.42 
 
 		 368 aa  185  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.04 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3098  Sec-independent protein translocase TatC  40.75 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.923548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.68 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  43.65 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.28 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  45.19 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  44.02 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  43.28 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  41.95 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  41.46 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>