More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3171 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.23 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  54.85 
 
 		 368 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.62 
 
 		 468 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.81 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.81 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.95 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.41 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  50 
 
 		 271 aa  235  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.1 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  46.34 
 
 		 323 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  48.18 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.46 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.56 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  42.46 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  44.44 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.29 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.08 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  46.4 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  45.13 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  38.58 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  44.72 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  37.89 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  40.74 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  40.46 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.46 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  37.55 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.49 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  38.89 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.74 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.61 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  41.83 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  41.87 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.7 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  43.53 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  39.51 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  42.5 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.19 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.19 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.19 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.19 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.19 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.6 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.37 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  40.16 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.67 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  42.63 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.48 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  44.14 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  41.91 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  39.36 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  40.73 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.19 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.35 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  40.33 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.47 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.15 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  42.04 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.25 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  38.82 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  40.65 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  42.04 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  42.04 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  41.37 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  37.25 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.21 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.86 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.86 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.85 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.02 
 
 		 253 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.25 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  39.18 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.8 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  36.9 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.86 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  42.92 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.51 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.75 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  36.9 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.46 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.46 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.38 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.71 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000498053  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.38 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.6 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.46 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  40.23 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.75 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.78 
 
 		 275 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  45.64 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  39.48 
 
 		 230 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>