More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0227 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
248 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  80.49 
 
 
247 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.96 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  43.32 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  42.34 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  42.34 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  42.34 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  42.74 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  43.32 
 
 
247 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.74 
 
 
247 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2243  TatCD protein  41.98 
 
 
242 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000509204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  44.05 
 
 
246 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3098  TatCD protein  44.14 
 
 
241 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000196448  hitchhiker  5.70028e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  43.98 
 
 
247 aa  178  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1021  Sec-independent protein translocase protein tatC  38.1 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.89 
 
 
264 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.4 
 
 
468 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.94 
 
 
324 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.66 
 
 
257 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.24 
 
 
339 aa  152  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.34 
 
 
257 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.66 
 
 
259 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.89 
 
 
260 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.66 
 
 
259 aa  151  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  35.92 
 
 
323 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  31.6 
 
 
266 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  34.85 
 
 
301 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.71 
 
 
242 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.78 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  35.78 
 
 
230 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.2 
 
 
266 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  31.45 
 
 
250 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  35.56 
 
 
368 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  33.61 
 
 
252 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.94 
 
 
268 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.61 
 
 
259 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  32.84 
 
 
281 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  33.61 
 
 
259 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  33.61 
 
 
251 aa  143  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  33.75 
 
 
244 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.8 
 
 
263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.59 
 
 
252 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.33 
 
 
258 aa  141  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.83 
 
 
251 aa  141  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  35.06 
 
 
262 aa  141  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  32.11 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.84 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.47 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.47 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.47 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.66 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.47 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.47 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.66 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.96 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.51 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.07 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.48 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  31.45 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.96 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.63 
 
 
398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  31.51 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.5 
 
 
247 aa  139  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  35.22 
 
 
266 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.41 
 
 
262 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  32.41 
 
 
262 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.23 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.85 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  31.85 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.85 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.12 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  32.72 
 
 
296 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  32.64 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  31.06 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.36 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.23 
 
 
271 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.76 
 
 
257 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35 
 
 
280 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.36 
 
 
275 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.68 
 
 
254 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.88 
 
 
283 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.75 
 
 
368 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  31.37 
 
 
271 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  30.21 
 
 
261 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  31.15 
 
 
263 aa  136  4e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.91 
 
 
260 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  34.18 
 
 
250 aa  135  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  32.62 
 
 
262 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.33 
 
 
250 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.98 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.19 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.96 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>