More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1535 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
280 aa  559  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  84.17 
 
 
242 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  69.33 
 
 
301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.77 
 
 
339 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1191  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  69.93 
 
 
286 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.134243  normal  0.295953 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1220  Sec-independent periplasmic protein translocase  72.01 
 
 
327 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.07 
 
 
288 aa  381  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  34.48 
 
 
267 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.64 
 
 
283 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4969  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.18 
 
 
285 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000729191  hitchhiker  0.000000000000138567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.85 
 
 
271 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  35.64 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.65 
 
 
324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3820  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.52 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00172839  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1619  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
269 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0981488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1460  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.403826  normal  0.0434954 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.4 
 
 
259 aa  161  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3888  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.69 
 
 
294 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0125  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.48 
 
 
259 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.95 
 
 
264 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.13 
 
 
257 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.8 
 
 
468 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.04 
 
 
252 aa  142  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.63 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.78 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.06 
 
 
261 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  36.75 
 
 
247 aa  139  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.25 
 
 
257 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  36.05 
 
 
283 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  38.1 
 
 
241 aa  138  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  35.25 
 
 
250 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.74 
 
 
253 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  34.58 
 
 
247 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1120  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.86 
 
 
256 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.32 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  30.86 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  31.4 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  34.19 
 
 
230 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  31.28 
 
 
261 aa  130  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  31.91 
 
 
323 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34 
 
 
268 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.95 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.02 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  29.63 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.23 
 
 
262 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.93 
 
 
336 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  31.65 
 
 
266 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  31.17 
 
 
247 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.9 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.69 
 
 
274 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  29.75 
 
 
247 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35 
 
 
248 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.93 
 
 
247 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.25 
 
 
250 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  33.47 
 
 
270 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1021  Sec-independent protein translocase protein tatC  33.62 
 
 
235 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  33.91 
 
 
245 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  29.84 
 
 
262 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  29.34 
 
 
247 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  33.48 
 
 
245 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  29.34 
 
 
247 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  29.34 
 
 
247 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
250 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  29.34 
 
 
247 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.3 
 
 
263 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  28.93 
 
 
247 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.47 
 
 
246 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
275 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  35.25 
 
 
368 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.45 
 
 
264 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.06 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.7 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.84 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.49 
 
 
398 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  33.48 
 
 
245 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.21 
 
 
266 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.88 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.09 
 
 
246 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  28.93 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2243  TatCD protein  29.29 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000509204  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  31.91 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.93 
 
 
246 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  34.29 
 
 
256 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  29.84 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.41 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.03 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.34 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.51 
 
 
251 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  31.6 
 
 
260 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.31 
 
 
275 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  32.23 
 
 
271 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  29.61 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  33.06 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  29.75 
 
 
261 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
266 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
266 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.3 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.26 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>