More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1578 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
279 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  69.35 
 
 
264 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  68.2 
 
 
264 aa  350  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  71.37 
 
 
254 aa  347  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.16 
 
 
255 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.16 
 
 
255 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  67.32 
 
 
278 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  61.45 
 
 
285 aa  324  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  63.56 
 
 
267 aa  279  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  53.15 
 
 
264 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43950  Tat family transporter: protein export TatC  55.87 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601024  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05201  Tat family protein secretion protein  51.48 
 
 
252 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0464  protein secretion component, Tat family  50.85 
 
 
238 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1732  Sec-independent periplasmic protein translocase  59.84 
 
 
267 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04891  Tat family protein secretion protein  50.63 
 
 
252 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1796  protein secretion component, Tat family  56.95 
 
 
239 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  56.5 
 
 
239 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05281  Tat family protein secretion protein  53.18 
 
 
252 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.35987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06661  protein secretion component, Tat family  61.86 
 
 
246 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.46 
 
 
324 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  34 
 
 
264 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.27 
 
 
257 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  33.74 
 
 
247 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  35.16 
 
 
230 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.08 
 
 
251 aa  135  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  32.91 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  33.59 
 
 
267 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  33.71 
 
 
267 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  32.81 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.94 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  31.68 
 
 
301 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  33.19 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  32.35 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  30.63 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.27 
 
 
252 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.65 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  35.12 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  35.54 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.84 
 
 
268 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.2 
 
 
264 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.43 
 
 
275 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  32.92 
 
 
251 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.67 
 
 
241 aa  125  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  33.62 
 
 
283 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  34.03 
 
 
269 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
275 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.2 
 
 
260 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.12 
 
 
250 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.2 
 
 
253 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.88 
 
 
263 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.23 
 
 
257 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.2 
 
 
253 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.13 
 
 
468 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  34.08 
 
 
266 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  30.74 
 
 
270 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  32.95 
 
 
308 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.84 
 
 
253 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  34.68 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.27 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.43 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.25 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  32.92 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  35.27 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.84 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.87 
 
 
253 aa  120  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  31.51 
 
 
251 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  34.36 
 
 
269 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.93 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.93 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  32.49 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.09 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.36 
 
 
247 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.75 
 
 
368 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  34.05 
 
 
250 aa  118  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.03 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.63 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.56 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.09 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.15 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  30.15 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  33.19 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.82 
 
 
259 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.62 
 
 
398 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.82 
 
 
259 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1191  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.51 
 
 
286 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.134243  normal  0.295953 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.82 
 
 
259 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.82 
 
 
259 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  30 
 
 
261 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.82 
 
 
259 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.92 
 
 
272 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.61 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>