More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1732 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1732  Sec-independent periplasmic protein translocase  100 
 
 
267 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  89.26 
 
 
267 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  70.78 
 
 
264 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1796  protein secretion component, Tat family  69.83 
 
 
239 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  69.4 
 
 
239 aa  324  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06661  protein secretion component, Tat family  83.33 
 
 
246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  60.94 
 
 
264 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  60.52 
 
 
254 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.51 
 
 
255 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.51 
 
 
255 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  59.02 
 
 
264 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05201  Tat family protein secretion protein  54.07 
 
 
252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04891  Tat family protein secretion protein  54.07 
 
 
252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0464  protein secretion component, Tat family  56.22 
 
 
238 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  53.39 
 
 
285 aa  278  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.03 
 
 
278 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  59.84 
 
 
279 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05281  Tat family protein secretion protein  52.02 
 
 
252 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.35987  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43950  Tat family transporter: protein export TatC  48.26 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601024  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.04 
 
 
259 aa  131  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.04 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.63 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  34.31 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.05 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  34.31 
 
 
262 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  33.89 
 
 
261 aa  126  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  36.63 
 
 
268 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  37.28 
 
 
256 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.6 
 
 
316 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  31.38 
 
 
271 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.9 
 
 
241 aa  123  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.03 
 
 
257 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.35 
 
 
468 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  34.43 
 
 
250 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.02 
 
 
250 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  33.18 
 
 
230 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  31.67 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.98 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.81 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.27 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.34 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.62 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  36.89 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.14 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.03 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  33.19 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.25 
 
 
272 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.65 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  31.02 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1626  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.92 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  34.04 
 
 
244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  30 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.33 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  37.83 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  31.56 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
257 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  33.62 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  33.05 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  32.06 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.61 
 
 
246 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.74 
 
 
268 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  31.74 
 
 
268 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  30.45 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  30.45 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  31.45 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.27 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2600  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.77 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.143785  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.28 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3258  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.78 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.33 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.35 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.69 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0982  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.35 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.61 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  32.33 
 
 
298 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.51 
 
 
249 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.33 
 
 
265 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.54 
 
 
253 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.02 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.82 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  29.26 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  29.41 
 
 
245 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.09 
 
 
280 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0754  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.94 
 
 
250 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0663389  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  32.77 
 
 
269 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1656  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.73 
 
 
270 aa  109  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.91 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1191  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.91 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.134243  normal  0.295953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.4 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  34.82 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.75 
 
 
258 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  31.12 
 
 
265 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  32.2 
 
 
368 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.75 
 
 
258 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.75 
 
 
258 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  34.35 
 
 
251 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.75 
 
 
258 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  32.75 
 
 
258 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>