More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1094 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
262 aa  526  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11740  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  47.86 
 
 
283 aa  259  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2831  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.6 
 
 
276 aa  257  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19830  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  53.41 
 
 
285 aa  255  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.98 
 
 
468 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.74 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  29.33 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.28 
 
 
336 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1796  protein secretion component, Tat family  28.51 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  32.31 
 
 
259 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.31 
 
 
259 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  30.38 
 
 
283 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  28.07 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.3 
 
 
259 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.22 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.22 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.06 
 
 
259 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.06 
 
 
259 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.06 
 
 
259 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.06 
 
 
259 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.06 
 
 
259 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.74 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.82 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  29.44 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.41 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  29.96 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.4 
 
 
251 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  29.31 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.45 
 
 
249 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  29.44 
 
 
256 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.33 
 
 
254 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  28.51 
 
 
264 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  30.67 
 
 
247 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  26.84 
 
 
271 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.48 
 
 
258 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.34 
 
 
241 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.56 
 
 
258 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.64 
 
 
261 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.78 
 
 
264 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  29.33 
 
 
285 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.29 
 
 
268 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  28.02 
 
 
298 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  28.45 
 
 
262 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  25.76 
 
 
285 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  30.17 
 
 
263 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.29 
 
 
266 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  25.86 
 
 
270 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  28.02 
 
 
262 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.96 
 
 
398 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.96 
 
 
324 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.51 
 
 
256 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.75 
 
 
258 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.57 
 
 
257 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  28.16 
 
 
279 aa  102  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1656  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.13 
 
 
270 aa  102  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.1 
 
 
321 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1606  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.47 
 
 
249 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  29.61 
 
 
230 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.2 
 
 
258 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1732  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.14 
 
 
267 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.34 
 
 
277 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.89 
 
 
253 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  26.67 
 
 
364 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.2 
 
 
258 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  32.47 
 
 
269 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.73 
 
 
298 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  27.31 
 
 
244 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  29.66 
 
 
270 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.94 
 
 
314 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.64 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.1 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.95 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.8 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  27.95 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  27.27 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.27 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.71 
 
 
268 aa  99.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.08 
 
 
263 aa  99  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.83 
 
 
249 aa  99.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.12 
 
 
247 aa  99  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04891  Tat family protein secretion protein  28.44 
 
 
252 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31 
 
 
262 aa  98.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  26.03 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.7 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  30.6 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  30 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.34 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.04 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>