More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11740 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11740  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2831  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  68.25 
 
 
276 aa  360  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19830  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  68.13 
 
 
285 aa  354  8.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.85 
 
 
262 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.26 
 
 
468 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.86 
 
 
336 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  33.19 
 
 
256 aa  122  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  33.19 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.3 
 
 
241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.34 
 
 
253 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  28.97 
 
 
261 aa  109  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.88 
 
 
326 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  29.37 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  28.97 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.36 
 
 
257 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.78 
 
 
249 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.59 
 
 
314 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.73 
 
 
316 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.31 
 
 
264 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.25 
 
 
242 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  28.35 
 
 
263 aa  104  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  28.95 
 
 
308 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.63 
 
 
324 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.03 
 
 
298 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  28.73 
 
 
271 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.24 
 
 
251 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  28.92 
 
 
257 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.23 
 
 
247 aa  102  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.64 
 
 
241 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  32.5 
 
 
364 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.85 
 
 
316 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  29.85 
 
 
316 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.85 
 
 
316 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  25.22 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.65 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.86 
 
 
268 aa  99.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.96 
 
 
321 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  25.86 
 
 
268 aa  99.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.66 
 
 
252 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1606  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.63 
 
 
249 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  26.21 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  27.05 
 
 
270 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.63 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.91 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.64 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.95 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.95 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.95 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.95 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.95 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0708  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.97 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  27.66 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.13 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.71 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.24 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.56 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.34 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  27.14 
 
 
289 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  27.83 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.68 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  27.14 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  29.05 
 
 
244 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.14 
 
 
289 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  27.27 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5556  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.59 
 
 
274 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.6 
 
 
262 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  27.6 
 
 
262 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.71 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.34 
 
 
258 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.64 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  24.9 
 
 
285 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.87 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.7 
 
 
287 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27 
 
 
265 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.64 
 
 
283 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  27.98 
 
 
245 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.69 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  28.63 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  27.98 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  28.4 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1120  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.42 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.31 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  26.64 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.86 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.19 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  27.97 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.34 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.24 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1796  protein secretion component, Tat family  25.1 
 
 
239 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  25.1 
 
 
239 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.02 
 
 
334 aa  89  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.81 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>