More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1795 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
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NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  77.56 
 
 		 346 aa  464  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
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NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  62.72 
 
 		 299 aa  348  7e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.42 
 
 		 287 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
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NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.84 
 
 		 280 aa  288  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.7 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0527172 
 
 
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NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  50.7 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.43 
 
 		 269 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.48 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.55 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  43.37 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  45.1 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  45.1 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.86 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  39.12 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.86 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.91 
 
 		 254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  41.01 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.5 
 
 		 275 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.03 
 
 		 280 aa  188  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
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NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  41.82 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
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NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.14 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.26 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
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NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.6 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
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NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  38.91 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.941523 
 
 
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NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.91 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
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NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.91 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  39.57 
 
 		 267 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
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NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  38.91 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  38.91 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.46 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
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NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  39.78 
 
 		 272 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
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NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40 
 
 		 269 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.09 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  41.03 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
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NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.19 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.35 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
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NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  38.77 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.42 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.51 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
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NC_002978  WD0452  MttB family protein  36.03 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  35.61 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  35.03 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  34.59 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.04 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.36 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.28 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
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NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  34.17 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.17 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.57 
 
 		 468 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  34.75 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.89 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  33.95 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  38.21 
 
 		 279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.96 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  35.84 
 
 		 262 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
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NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  34.74 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  34.46 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.09 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  33.95 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  38.41 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.78 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
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NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  34.94 
 
 		 245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.82 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  34.94 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  34.94 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.29 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.71 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.09 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.69 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  30.53 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  30.15 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.46 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.71 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.94 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.94 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  31.41 
 
 		 244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
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NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.22 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.03 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  31.54 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  31.18 
 
 		 249 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.6 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  33.46 
 
 		 250 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
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NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.8 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  32.08 
 
 		 266 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.47 
 
 		 263 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.23 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  30.94 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.34 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
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NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.79 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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