More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2788 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
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NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  93.61 
 
 		 272 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
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NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  86.4 
 
 		 271 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.941523 
 
 
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NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  84.21 
 
 		 269 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
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NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  92.4 
 
 		 269 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  87.2 
 
 		 282 aa  434  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  90.32 
 
 		 271 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
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NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.16 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
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NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  61.24 
 
 		 266 aa  332  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
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NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  61.24 
 
 		 266 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  61.96 
 
 		 266 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
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NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.02 
 
 		 263 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
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NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.86 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.32 
 
 		 269 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  61.3 
 
 		 263 aa  308  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  57.89 
 
 		 270 aa  304  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.27 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.94 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.41 
 
 		 262 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
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NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  55.91 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  57.74 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  57.74 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.63 
 
 		 280 aa  285  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.17 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.61 
 
 		 275 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.36 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  53.01 
 
 		 323 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.13 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
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NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  49.03 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  46.53 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  47.06 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  47.97 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  45.56 
 
 		 263 aa  208  8e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  45.12 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0452  MttB family protein  45.56 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.94 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  43.02 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
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NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  49.2 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  39.29 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
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NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.8 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.1 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
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NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  38.65 
 
 		 299 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.23 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.49 
 
 		 468 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.89 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
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NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.17 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  39.3 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.3 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0527172 
 
 
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NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.74 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.3 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  41.49 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  37.2 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  36.3 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  34 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.38 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  35.38 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.68 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  37.25 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
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NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.09 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  38.98 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.56 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.02 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.02 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.85 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  37.3 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.3 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  35.6 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.63 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  38.49 
 
 		 251 aa  165  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  37.45 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  36.86 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.09 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.09 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.79 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.21 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.33 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  36.47 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.85 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  39.75 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  35.42 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  37.6 
 
 		 249 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  37.5 
 
 		 262 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
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NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  40.25 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.02 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.02 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.02 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
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NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.02 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
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NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.09 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.61 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.09 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.09 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.09 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.09 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.32 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.32 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.32 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.32 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
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NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.32 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.32 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
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