More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2515 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  88.93 
 
 		 269 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  86.79 
 
 		 267 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  81.11 
 
 		 269 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  86.4 
 
 		 282 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  83.6 
 
 		 271 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  90.8 
 
 		 272 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.49 
 
 		 266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.31 
 
 		 266 aa  331  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.31 
 
 		 266 aa  331  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.92 
 
 		 266 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.49 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.82 
 
 		 263 aa  325  6e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  64.23 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.55 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.4 
 
 		 274 aa  301  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.4 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.7 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  56.98 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  58.65 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  58.65 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  54.72 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.61 
 
 		 280 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.75 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.47 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  52.82 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.85 
 
 		 254 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.4 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.84 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  47.74 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  49.16 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  49.6 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  48.29 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  46.34 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  47.01 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  48.57 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.5 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.54 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  44.9 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  40.7 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  50.2 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.71 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.02 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.98 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.92 
 
 		 468 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  38.55 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  38.55 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.55 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  35.74 
 
 		 346 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.26 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.37 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.02 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.69 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.69 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  36.26 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.81 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  41.84 
 
 		 368 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.4 
 
 		 324 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.69 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.62 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  40.81 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  41.85 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.6 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  37.6 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.5 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.42 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.14 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  42.36 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.14 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.27 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.32 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  41.7 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  37.7 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  34.32 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.93 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  38.4 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  36.44 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  41.03 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.74 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.51 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.51 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.51 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.51 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  35.56 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  39.75 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  36.44 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  38.3 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  36.03 
 
 		 249 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.24 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.8 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  38.02 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.71 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>