More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1345 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  100 
 
 		 346 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  76.73 
 
 		 296 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  59.94 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.72 
 
 		 280 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.05 
 
 		 287 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  50.49 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.49 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.25 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.2 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  40.13 
 
 		 288 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  40.06 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  40.06 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.59 
 
 		 268 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.59 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.46 
 
 		 272 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  37.04 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.21 
 
 		 275 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  36.48 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.88 
 
 		 275 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.33 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.31 
 
 		 266 aa  176  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.31 
 
 		 266 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.31 
 
 		 266 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  36.52 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.12 
 
 		 263 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.65 
 
 		 300 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  36.12 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.89 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.54 
 
 		 262 aa  165  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  35.14 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  33.75 
 
 		 267 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.13 
 
 		 263 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.03 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  34.92 
 
 		 272 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  35.14 
 
 		 282 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.61 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.13 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.9 
 
 		 257 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.22 
 
 		 264 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.5 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 		 468 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  35.37 
 
 		 271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  36.55 
 
 		 269 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  34.12 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  31.9 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  32.17 
 
 		 249 aa  146  5e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  31.25 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.03 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  33.11 
 
 		 263 aa  143  5e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  33.11 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  36 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.59 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.41 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.47 
 
 		 241 aa  138  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.06 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  30 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  28.01 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.77 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.09 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  30.5 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  30.63 
 
 		 269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  30.72 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.76 
 
 		 263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.54 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.42 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.24 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.94 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  29.21 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  29.86 
 
 		 251 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.72 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  32.06 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.51 
 
 		 241 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  27.43 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  29.43 
 
 		 244 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  28.39 
 
 		 266 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.71 
 
 		 258 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  35.23 
 
 		 255 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  28.3 
 
 		 249 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  29.14 
 
 		 267 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.14 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  28.3 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.67 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.72 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  28.25 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.67 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.1 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  31.83 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.25 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  31.49 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  31.49 
 
 		 245 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.45 
 
 		 258 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>