More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2666 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  100 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  82.53 
 
 		 275 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  81.41 
 
 		 275 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  80.8 
 
 		 280 aa  417  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
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NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  73.78 
 
 		 274 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  72.05 
 
 		 288 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  73.68 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  73.68 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  57.94 
 
 		 271 aa  292  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.941523 
 
 
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NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.55 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.56 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.87 
 
 		 269 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  57.89 
 
 		 267 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
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NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  57.31 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  54.14 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
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NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.61 
 
 		 266 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
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NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.87 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.87 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.08 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
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NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.8 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  57.71 
 
 		 272 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
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NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.09 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.1 
 
 		 263 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
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NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.49 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
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NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  58.57 
 
 		 271 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
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NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  51.37 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.15 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
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NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.43 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.6 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  45.1 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  47.13 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  47.11 
 
 		 249 aa  222  6e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  44.57 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
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NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.49 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
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NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  39.12 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.81 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
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NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  45.72 
 
 		 269 aa  201  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  42.69 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  40 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.7 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002978  WD0452  MttB family protein  42.46 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  46.21 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  36.48 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
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NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  40.15 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.15 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0527172 
 
 
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NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  43.8 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.54 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
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NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.02 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.45 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.45 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  38.82 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.55 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.08 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  37.78 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  36.63 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  35.74 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
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NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  39.51 
 
 		 241 aa  170  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  36.88 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  37.41 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.54 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
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NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.45 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  39 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.11 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.75 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.43 
 
 		 468 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_1055  Sec-independent protein translocase TatC  41.13 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  39.7 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  36.33 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.09 
 
 		 268 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  36.09 
 
 		 268 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.42 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  41.08 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  35.85 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.94 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.85 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.59 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  38.1 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  36.96 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.21 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.88 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.88 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.88 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.88 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.88 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  36.72 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.02 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  37.1 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.11 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  35.38 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.52 
 
 		 248 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35 
 
 		 249 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.4 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
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NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  34.23 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.74 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  38.98 
 
 		 368 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  35 
 
 		 249 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.59 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
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NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.59 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.59 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
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