More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1981 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
287 aa  577  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  86.23 
 
 
289 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  86.23 
 
 
289 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.66 
 
 
280 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  53.29 
 
 
299 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  53.42 
 
 
296 aa  289  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  52.73 
 
 
346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  43.98 
 
 
323 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.82 
 
 
268 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.36 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.27 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.27 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  44.4 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.55 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.41 
 
 
274 aa  211  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.3 
 
 
266 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.46 
 
 
264 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.08 
 
 
254 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.6 
 
 
269 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  42.69 
 
 
271 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  44.65 
 
 
274 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  44.65 
 
 
274 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.78 
 
 
275 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  40.81 
 
 
270 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.85 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.68 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.81 
 
 
263 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.98 
 
 
263 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.41 
 
 
263 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.74 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  40.68 
 
 
269 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.01 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  39.1 
 
 
267 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  38.17 
 
 
271 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  39.54 
 
 
282 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  39.85 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  42.01 
 
 
269 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  35.14 
 
 
250 aa  176  6e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  36.8 
 
 
249 aa  175  7e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  37.6 
 
 
253 aa  175  9e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  44.74 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  40.23 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.39 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.32 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.66 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.83 
 
 
251 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.33 
 
 
253 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.18 
 
 
241 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.46 
 
 
259 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  35.93 
 
 
263 aa  166  5e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  42.75 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  36.9 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.19 
 
 
468 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.93 
 
 
264 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  35.41 
 
 
247 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  34.25 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.25 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  36.96 
 
 
250 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.09 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  32.55 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  32.55 
 
 
245 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  32.16 
 
 
245 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  33.07 
 
 
262 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.57 
 
 
257 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  35.66 
 
 
247 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.81 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.73 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.93 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  31.73 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  31.89 
 
 
368 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  34.09 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.39 
 
 
269 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  30 
 
 
249 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  32.02 
 
 
250 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.07 
 
 
336 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.86 
 
 
253 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  32.95 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.62 
 
 
256 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1656  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.13 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  29.82 
 
 
257 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.6 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  31.75 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.39 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.6 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  30.8 
 
 
244 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  31.14 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.27 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  31.17 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  30.29 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.32 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.6 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.22 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>