More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3401 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 266 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 266 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  96.99 
 
 		 266 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  89.06 
 
 		 266 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  84.19 
 
 		 264 aa  434  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  85.83 
 
 		 263 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  61.63 
 
 		 271 aa  324  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  61.83 
 
 		 269 aa  315  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  61.24 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  62.06 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.18 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  64.08 
 
 		 272 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  65.57 
 
 		 271 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  61.72 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  65.62 
 
 		 269 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.3 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.61 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.56 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  53.08 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  51.87 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.32 
 
 		 275 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  55.22 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  55.22 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.15 
 
 		 280 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.56 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  47.86 
 
 		 323 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.08 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.97 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.15 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  46.22 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.19 
 
 		 263 aa  214  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  44.35 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.27 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  43.78 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  47.52 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.82 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  43.82 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  42.8 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.67 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  42.51 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  44.84 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  43.35 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  38.71 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  40.91 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.8 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.86 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  37.59 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.57 
 
 		 468 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  37.22 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  45.35 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  38.24 
 
 		 346 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  37.15 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  36.36 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.65 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.83 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  40.83 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.04 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.04 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.65 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  40.17 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  41.56 
 
 		 250 aa  165  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  39.44 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  39.21 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  39.39 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  37.29 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.46 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.67 
 
 		 264 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.07 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.6 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.03 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.07 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  35.34 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.07 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.07 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.07 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  35.85 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  38.7 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.43 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  39.42 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.25 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  38.62 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  37.99 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  37.75 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.8 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  40 
 
 		 368 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  36.29 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  36.73 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.72 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.5 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  36.84 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  37.8 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>