More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0884 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0884  Sec-independent protein translocase protein TatC  100 
 
 
274 aa  549  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0875  twin arginine-targeting protein translocase TatC  100 
 
 
274 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.965079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  94.89 
 
 
274 aa  527  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  76.47 
 
 
288 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  73.13 
 
 
270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  78.54 
 
 
280 aa  400  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  72.62 
 
 
275 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  72.32 
 
 
275 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.25 
 
 
272 aa  308  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4405  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  60 
 
 
269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.632551  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  59.13 
 
 
271 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.22 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.22 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.97 
 
 
266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2788  Sec-independent protein translocase TatC  57.74 
 
 
267 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23913  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1777  sec-independent periplasmic protein translocase  56.3 
 
 
269 aa  278  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0307477  decreased coverage  0.00398359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.27 
 
 
263 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.02 
 
 
266 aa  275  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.96 
 
 
269 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.600412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  54.26 
 
 
323 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1790  Sec-independent protein translocase TatC  57.48 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2743  Sec-independent protein translocase TatC  59.36 
 
 
272 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.269843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.15 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2515  Sec-independent protein translocase TatC  60.4 
 
 
271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106541  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.71 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2487  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.51 
 
 
263 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.63 
 
 
262 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.58 
 
 
254 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  50.78 
 
 
271 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.47 
 
 
268 aa  248  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.21 
 
 
280 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  44.57 
 
 
299 aa  218  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  45.1 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  44.67 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.65 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  45.04 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  45.16 
 
 
253 aa  210  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  42.47 
 
 
263 aa  209  5e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  40.53 
 
 
346 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  44.12 
 
 
289 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.12 
 
 
289 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  43.61 
 
 
271 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  44.57 
 
 
269 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.78 
 
 
263 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.59 
 
 
257 aa  188  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  48.25 
 
 
255 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.62 
 
 
264 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.78 
 
 
324 aa  182  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  44.22 
 
 
279 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.06 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  39.06 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.31 
 
 
468 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  40.16 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.6 
 
 
253 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  37.19 
 
 
241 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  38.55 
 
 
269 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.17 
 
 
257 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  35.97 
 
 
266 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.96 
 
 
264 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.84 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.26 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  35.04 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  36.1 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.04 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  37.74 
 
 
249 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.58 
 
 
263 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.69 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.69 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  38.52 
 
 
262 aa  162  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.5 
 
 
260 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.32 
 
 
262 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  38.15 
 
 
250 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.74 
 
 
259 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  36.15 
 
 
266 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.74 
 
 
259 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.74 
 
 
259 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.57 
 
 
247 aa  159  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.74 
 
 
259 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.74 
 
 
259 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
257 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.85 
 
 
258 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.03 
 
 
398 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.34 
 
 
265 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  37.45 
 
 
368 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  32.45 
 
 
257 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  36.29 
 
 
251 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  35.16 
 
 
249 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  35.82 
 
 
262 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.82 
 
 
262 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  36.92 
 
 
255 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  35.94 
 
 
249 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.56 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>