More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0387 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  79.55 
 
 
264 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  75 
 
 
254 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  74.32 
 
 
255 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  74.32 
 
 
255 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  71.37 
 
 
278 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  67.43 
 
 
285 aa  349  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  68.2 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  61.37 
 
 
267 aa  278  7e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1796  protein secretion component, Tat family  60.18 
 
 
239 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1732  Sec-independent periplasmic protein translocase  59.02 
 
 
267 aa  264  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43950  Tat family transporter: protein export TatC  55.6 
 
 
284 aa  264  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601024  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  59.73 
 
 
239 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05201  Tat family protein secretion protein  51.98 
 
 
252 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  54.24 
 
 
264 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0464  protein secretion component, Tat family  52.21 
 
 
238 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04891  Tat family protein secretion protein  51.98 
 
 
252 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05281  Tat family protein secretion protein  47.35 
 
 
252 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.35987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06661  protein secretion component, Tat family  60.09 
 
 
246 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  38.33 
 
 
262 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.41 
 
 
324 aa  148  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  37.89 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  37.89 
 
 
261 aa  145  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.02 
 
 
257 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.62 
 
 
264 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.91 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  35.22 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  35.91 
 
 
230 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.19 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  35.86 
 
 
250 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.4 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.39 
 
 
468 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  34.15 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.07 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.74 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  35.22 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  33.19 
 
 
251 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.3 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.31 
 
 
241 aa  125  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  35.77 
 
 
288 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37 
 
 
257 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  36.44 
 
 
244 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.82 
 
 
263 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.24 
 
 
241 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  34.2 
 
 
256 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.91 
 
 
257 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.78 
 
 
242 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  32.76 
 
 
266 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  31.25 
 
 
270 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  31.54 
 
 
270 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  31.78 
 
 
283 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.72 
 
 
253 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1191  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.1 
 
 
286 aa  121  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.134243  normal  0.295953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.61 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  30.17 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.12 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  35.68 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  37.5 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.93 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.29 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.67 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  33.04 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0982  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.08 
 
 
311 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  37.04 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  32.94 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.76 
 
 
259 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  33.88 
 
 
250 aa  119  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  30.8 
 
 
299 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0587  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.59 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.851675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.1 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.28 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  32.92 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.08 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  33.18 
 
 
252 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3258  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
311 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.47 
 
 
336 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.54 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  32.2 
 
 
249 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  31.36 
 
 
368 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  31.56 
 
 
267 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  28.62 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4415  putative Sec-independent protein translocase protein TatC  34.45 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.941523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  33.62 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.48 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.16 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.65 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.47 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.19 
 
 
246 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.07 
 
 
264 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  32.02 
 
 
251 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  33.47 
 
 
249 aa  113  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.32 
 
 
268 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.56 
 
 
258 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.18 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.18 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  32.59 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.18 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.18 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.18 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>