More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  100 
 
 
268 aa  542  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.65 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.44 
 
 
276 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.63 
 
 
321 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.13 
 
 
262 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18520  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  41.28 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.019467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.82 
 
 
264 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  normal  0.256476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.26 
 
 
285 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  38.55 
 
 
285 aa  175  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1779  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.97 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1927  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.01 
 
 
264 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000008002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.79 
 
 
283 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  36.47 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  36.15 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00236204  normal  0.0970018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2184  Sec-independent protein translocase TatC  37.24 
 
 
264 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0433805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  36.86 
 
 
298 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  32.73 
 
 
330 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  35.36 
 
 
284 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.16 
 
 
298 aa  148  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1768  Sec-independent protein translocase TatC  37.5 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.708126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.84 
 
 
317 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.22 
 
 
316 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.45 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  32.84 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.97 
 
 
336 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.61 
 
 
326 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  32.65 
 
 
316 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.65 
 
 
316 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.31 
 
 
316 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  35.68 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.41 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.37 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.51 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.51 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  32.34 
 
 
364 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  30.16 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2690  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.57 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.78 
 
 
334 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.92 
 
 
241 aa  116  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.71 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  32.92 
 
 
279 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.63 
 
 
278 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.54 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  32.57 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.63 
 
 
468 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.5 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  31.54 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  32.32 
 
 
266 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  32.61 
 
 
271 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.15 
 
 
347 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.44 
 
 
247 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  35.77 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  31.2 
 
 
247 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  30.86 
 
 
265 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.2 
 
 
264 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.92 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.83 
 
 
247 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1732  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.63 
 
 
267 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1796  protein secretion component, Tat family  32.38 
 
 
239 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.2 
 
 
264 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.89 
 
 
257 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.31 
 
 
254 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  31.97 
 
 
239 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.72 
 
 
259 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  32.24 
 
 
250 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.31 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.64 
 
 
262 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.31 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.31 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  30.59 
 
 
264 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.31 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.31 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.64 
 
 
262 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  29.07 
 
 
264 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.43 
 
 
262 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.57 
 
 
268 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  28.63 
 
 
245 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.41 
 
 
258 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  31.93 
 
 
285 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  28.45 
 
 
270 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.98 
 
 
263 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.45 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  28.23 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  31.2 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.45 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  28.63 
 
 
245 aa  99  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  31.84 
 
 
278 aa  99  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32 
 
 
264 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.67 
 
 
270 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.43 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.3 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.46 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  30.3 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.99 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.2 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.3 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.51 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  31.1 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43950  Tat family transporter: protein export TatC  32.4 
 
 
284 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601024  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.04 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>