More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2653 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 
284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.91 
 
 
283 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  41.42 
 
 
298 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  39.44 
 
 
278 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.65 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  39.43 
 
 
330 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.44 
 
 
336 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.71 
 
 
321 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.02 
 
 
362 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.5 
 
 
317 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.65 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.63 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.31 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  40.15 
 
 
364 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  34.2 
 
 
273 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00236204  normal  0.0970018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.46 
 
 
334 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.79 
 
 
347 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1768  Sec-independent protein translocase TatC  44.44 
 
 
303 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.708126  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  36.21 
 
 
308 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.36 
 
 
326 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.07 
 
 
296 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  39.36 
 
 
321 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  37.5 
 
 
285 aa  152  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  36.61 
 
 
316 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.61 
 
 
316 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  35.36 
 
 
268 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.26 
 
 
252 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.27 
 
 
316 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.17 
 
 
285 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1927  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.07 
 
 
264 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000008002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2184  Sec-independent protein translocase TatC  38.06 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0433805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.67 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1779  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.11 
 
 
246 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  35.77 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.77 
 
 
267 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.63 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.37 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000249475  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2690  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.58 
 
 
324 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18520  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  32.42 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.019467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.69 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  34.22 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.47 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
262 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
262 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.58 
 
 
368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.82 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.04 
 
 
253 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  34.52 
 
 
247 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  32.09 
 
 
261 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  35.32 
 
 
270 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.17 
 
 
264 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  32.3 
 
 
301 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.47 
 
 
256 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  32.08 
 
 
252 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  31.92 
 
 
266 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  29.21 
 
 
258 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0754  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.25 
 
 
250 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0663389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.47 
 
 
257 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.82 
 
 
249 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.01 
 
 
270 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.27 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.1 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.13 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.46 
 
 
398 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.5 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  31.78 
 
 
249 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.96 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.09 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  34.85 
 
 
265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.65 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.65 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  32.56 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.65 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.65 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.13 
 
 
250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.47 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  29.59 
 
 
271 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  34.25 
 
 
250 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  32.42 
 
 
368 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.93 
 
 
259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.2 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.05 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  32.79 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  32.84 
 
 
251 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.9 
 
 
248 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.89 
 
 
249 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.1 
 
 
251 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>