More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14020 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00236204  normal  0.0970018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.04 
 
 
252 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18520  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  41.2 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.019467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1927  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.77 
 
 
264 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000008002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.5 
 
 
285 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.78 
 
 
321 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  40.25 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.35 
 
 
264 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  normal  0.256476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2184  Sec-independent protein translocase TatC  39.67 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0433805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.3 
 
 
276 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  33.93 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.22 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.32 
 
 
298 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  36.15 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  34.2 
 
 
284 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.46 
 
 
283 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.06 
 
 
316 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.68 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1779  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.18 
 
 
246 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  33.73 
 
 
278 aa  149  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  34.83 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.64 
 
 
317 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.32 
 
 
362 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  32.17 
 
 
308 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.46 
 
 
296 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.79 
 
 
316 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.99 
 
 
314 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1768  Sec-independent protein translocase TatC  35.58 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.708126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.25 
 
 
336 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.49 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  31.83 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.83 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.16 
 
 
334 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  31.43 
 
 
364 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  29.08 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  30.68 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.03 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  33.72 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.72 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.8 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.12 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.6 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  31.25 
 
 
268 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.25 
 
 
268 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  31.25 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.69 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  27.8 
 
 
250 aa  110  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0917  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.64 
 
 
258 aa  109  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.23831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  30.3 
 
 
266 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.33 
 
 
241 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.07 
 
 
249 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.77 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.6 
 
 
267 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  30.71 
 
 
267 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.44 
 
 
251 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  28.57 
 
 
249 aa  106  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  31.08 
 
 
266 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.69 
 
 
300 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.443277  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  29.28 
 
 
271 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  30.36 
 
 
271 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  30.43 
 
 
257 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.41 
 
 
277 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.59 
 
 
262 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  30.3 
 
 
323 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.73 
 
 
248 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  30.28 
 
 
262 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.59 
 
 
262 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.46 
 
 
260 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  28.29 
 
 
252 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.34 
 
 
268 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.55 
 
 
262 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.46 
 
 
259 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.58 
 
 
254 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2690  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.73 
 
 
324 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  29.64 
 
 
283 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.46 
 
 
264 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  28.93 
 
 
270 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.17 
 
 
266 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  28.05 
 
 
278 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.23 
 
 
263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  31.39 
 
 
299 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.24 
 
 
468 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0167  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.5 
 
 
256 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  26.98 
 
 
247 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  29.18 
 
 
251 aa  99  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.29 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.45 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000249475  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0544  Sec-independent protein translocase TatC  31.58 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.371966  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  32.32 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.7 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  32.77 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.83 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  27.91 
 
 
261 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.69 
 
 
241 aa  97.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.48 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.51 
 
 
398 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.4 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  26.77 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.85 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.77 
 
 
246 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>