More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1883 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.76 
 
 
252 aa  247  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.11 
 
 
264 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  normal  0.256476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18520  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  45.1 
 
 
275 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.019467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  41.7 
 
 
285 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.94 
 
 
321 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1927  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.7 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000008002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2184  Sec-independent protein translocase TatC  45.2 
 
 
264 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0433805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  40.5 
 
 
278 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.74 
 
 
262 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.9 
 
 
276 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.4 
 
 
298 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  37.5 
 
 
273 aa  185  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00236204  normal  0.0970018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1779  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.69 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  39.26 
 
 
268 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.62 
 
 
336 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  38.46 
 
 
298 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.5 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.43 
 
 
296 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.06 
 
 
317 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.02 
 
 
316 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  34.77 
 
 
330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1768  Sec-independent protein translocase TatC  41.09 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.708126  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  37.98 
 
 
364 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  36.17 
 
 
284 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.19 
 
 
362 aa  158  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  35.21 
 
 
308 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.27 
 
 
347 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.8 
 
 
326 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.89 
 
 
316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  36.24 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.24 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  31.11 
 
 
271 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.93 
 
 
314 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.57 
 
 
334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.24 
 
 
316 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  35.59 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2690  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.73 
 
 
324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.6 
 
 
264 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  35.69 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.03 
 
 
259 aa  119  7e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.76 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  33.86 
 
 
256 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0754  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.23 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0663389  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  29.77 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.36 
 
 
278 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  32.74 
 
 
269 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.8 
 
 
270 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  29.39 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  29.84 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.93 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.48 
 
 
468 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.66 
 
 
251 aa  113  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.67 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.34 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  36.53 
 
 
255 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.61 
 
 
257 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.83 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  31.3 
 
 
269 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.18 
 
 
254 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0075  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.47 
 
 
324 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  30.55 
 
 
323 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  31.7 
 
 
270 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.92 
 
 
268 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.45 
 
 
263 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.27 
 
 
247 aa  106  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.48 
 
 
259 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  29.92 
 
 
268 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  27.59 
 
 
250 aa  106  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.3 
 
 
266 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  30 
 
 
266 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0917  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.71 
 
 
258 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.23831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  29.92 
 
 
262 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.67 
 
 
255 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.67 
 
 
255 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  28.35 
 
 
271 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30 
 
 
257 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  28.91 
 
 
278 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.67 
 
 
254 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  28.31 
 
 
263 aa  102  7e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  27.48 
 
 
249 aa  102  7e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  32.14 
 
 
244 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  28.33 
 
 
294 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  30.2 
 
 
245 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  29.83 
 
 
264 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.31 
 
 
264 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  30.59 
 
 
245 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05191  Tat family protein secretion protein  30.77 
 
 
239 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.593552  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.64 
 
 
257 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.48 
 
 
262 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1796  protein secretion component, Tat family  30.77 
 
 
239 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.71 
 
 
263 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.59 
 
 
250 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  26.39 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  27.99 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  27.51 
 
 
261 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  29.8 
 
 
245 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.86 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0630  Sec-independent protein translocase TatC  31.52 
 
 
267 aa  99  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.59388  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  30.86 
 
 
259 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>