More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2252 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
362 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  59.27 
 
 
321 aa  351  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  50.68 
 
 
308 aa  292  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.81 
 
 
316 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.14 
 
 
314 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  47.81 
 
 
326 aa  289  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.66 
 
 
316 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  50 
 
 
316 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50 
 
 
316 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.63 
 
 
347 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.77 
 
 
334 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.92 
 
 
296 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.24 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.63 
 
 
276 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000249475  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  41.22 
 
 
298 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  41.03 
 
 
278 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  37.95 
 
 
364 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.44 
 
 
298 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.69 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.89 
 
 
317 aa  195  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2690  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.26 
 
 
324 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.61 
 
 
316 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  35.39 
 
 
330 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.07 
 
 
321 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  39.02 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1768  Sec-independent protein translocase TatC  35.84 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.708126  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.19 
 
 
285 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  36.78 
 
 
285 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  37.32 
 
 
273 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00236204  normal  0.0970018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  33.73 
 
 
271 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.12 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  32.48 
 
 
323 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.15 
 
 
468 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0917  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.6 
 
 
258 aa  123  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.23831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.53 
 
 
262 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.84 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.08 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.8 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  normal  0.256476 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  32.68 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.05 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  32.13 
 
 
266 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  29.37 
 
 
268 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.29 
 
 
251 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.28 
 
 
268 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.96 
 
 
254 aa  119  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.27 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.74 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.05 
 
 
261 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.08 
 
 
275 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.3 
 
 
268 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.11 
 
 
247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.87 
 
 
276 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.47 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.68 
 
 
275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.67 
 
 
368 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.03 
 
 
398 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.84 
 
 
257 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18520  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  37.71 
 
 
275 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.019467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1242  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.16 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00016128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  31.27 
 
 
251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  30.8 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  39.58 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.54 
 
 
242 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  31.13 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  32.44 
 
 
249 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  32.93 
 
 
368 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.1 
 
 
259 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2600  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.05 
 
 
282 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.143785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1626  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.05 
 
 
282 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.84 
 
 
262 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  31.84 
 
 
262 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.77 
 
 
241 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.82 
 
 
257 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.42 
 
 
253 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.55 
 
 
252 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.68 
 
 
257 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1486  MttB family protein  31.05 
 
 
288 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5556  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.37 
 
 
274 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1779  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.82 
 
 
246 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000101866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  31.56 
 
 
275 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.4 
 
 
262 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  32.16 
 
 
288 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  30.38 
 
 
247 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.39 
 
 
289 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.71 
 
 
262 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  29.62 
 
 
247 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.71 
 
 
262 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1927  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.77 
 
 
264 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000008002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.3 
 
 
246 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  32.66 
 
 
271 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  30.08 
 
 
278 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  29.62 
 
 
247 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.67 
 
 
278 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000498053  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.8 
 
 
277 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  30.65 
 
 
250 aa  105  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.33 
 
 
272 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.83 
 
 
258 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  32.39 
 
 
263 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.39 
 
 
265 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  34.84 
 
 
262 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>