More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3892 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
276 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000249475  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  71.89 
 
 
347 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.45 
 
 
314 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  50.37 
 
 
308 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.63 
 
 
362 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.57 
 
 
316 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.08 
 
 
326 aa  248  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.75 
 
 
316 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  50.38 
 
 
316 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.38 
 
 
316 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  49.63 
 
 
321 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.79 
 
 
336 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.68 
 
 
334 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  42.96 
 
 
278 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.45 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  44.73 
 
 
364 aa  185  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.58 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.59 
 
 
283 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  40.37 
 
 
298 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2690  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.85 
 
 
324 aa  175  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.07 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  36.46 
 
 
330 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.38 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.17 
 
 
316 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  40.37 
 
 
284 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1768  Sec-independent protein translocase TatC  36.16 
 
 
303 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.708126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.86 
 
 
252 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0917  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.62 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.23831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  33.21 
 
 
273 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00236204  normal  0.0970018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  29.75 
 
 
268 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.78 
 
 
276 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.03 
 
 
246 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  30.3 
 
 
271 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.25 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.88 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18520  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  34.76 
 
 
275 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.019467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.56 
 
 
324 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1927  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.85 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000008002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.2 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.06 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1626  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.47 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.04 
 
 
468 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1779  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.43 
 
 
246 aa  112  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  31.4 
 
 
285 aa  112  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.32 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  normal  0.256476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2600  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.11 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.143785  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.75 
 
 
241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.79 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.59 
 
 
246 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.73 
 
 
242 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.03 
 
 
277 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.75 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.21 
 
 
250 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.7 
 
 
257 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.01 
 
 
268 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.72 
 
 
255 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  35.06 
 
 
269 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.8 
 
 
252 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.2 
 
 
339 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  31.1 
 
 
270 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.41 
 
 
249 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.1 
 
 
266 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.71 
 
 
278 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2703  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.09 
 
 
263 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.1 
 
 
268 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  29.46 
 
 
278 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.42 
 
 
251 aa  105  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.29 
 
 
254 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.18 
 
 
257 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  28.3 
 
 
247 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.31 
 
 
275 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.8 
 
 
249 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.87 
 
 
289 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  29.34 
 
 
251 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.14 
 
 
275 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.36 
 
 
259 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.01 
 
 
265 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  32.67 
 
 
250 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  29.6 
 
 
266 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.8 
 
 
258 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  30.37 
 
 
266 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.94 
 
 
258 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.94 
 
 
258 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.94 
 
 
258 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  25.37 
 
 
247 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  26.04 
 
 
247 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  30.37 
 
 
266 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.86 
 
 
241 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  31.93 
 
 
263 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.84 
 
 
247 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  24.44 
 
 
247 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.15 
 
 
262 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>