More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2170 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
334 aa  675    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.91 
 
 
326 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  59.72 
 
 
308 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.13 
 
 
316 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  56.13 
 
 
316 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.13 
 
 
316 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  54.93 
 
 
314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.8 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.84 
 
 
362 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.52 
 
 
347 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  47.14 
 
 
321 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.21 
 
 
336 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  39.04 
 
 
364 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  40.64 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2690  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.62 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.5 
 
 
283 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.63 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.34 
 
 
298 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  39.15 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  34.34 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.68 
 
 
276 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000249475  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.85 
 
 
316 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.48 
 
 
317 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1768  Sec-independent protein translocase TatC  41.74 
 
 
303 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.708126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  35.46 
 
 
284 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.82 
 
 
321 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.57 
 
 
285 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  33.56 
 
 
285 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.48 
 
 
252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  31.16 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00236204  normal  0.0970018 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0917  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.82 
 
 
258 aa  125  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.23831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35 
 
 
276 aa  125  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.52 
 
 
264 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.39 
 
 
468 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  29.78 
 
 
268 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.8 
 
 
268 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.14 
 
 
246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  32.13 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.19 
 
 
264 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  normal  0.256476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  30.04 
 
 
247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.71 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  29.67 
 
 
247 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.82 
 
 
255 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.89 
 
 
278 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  30.04 
 
 
247 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  29.6 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  29.6 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.67 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1779  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.8 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  29.6 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  33.09 
 
 
275 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.42 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.2 
 
 
249 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.23 
 
 
339 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2243  TatCD protein  29.56 
 
 
242 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000509204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.46 
 
 
262 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.57 
 
 
324 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  29.81 
 
 
256 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.91 
 
 
258 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.91 
 
 
258 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.09 
 
 
262 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.55 
 
 
265 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  28.79 
 
 
271 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.91 
 
 
258 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  28.15 
 
 
258 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  28.84 
 
 
251 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  32.5 
 
 
266 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.52 
 
 
262 aa  106  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  31.14 
 
 
323 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.12 
 
 
262 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  30.12 
 
 
262 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.11 
 
 
275 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  29.48 
 
 
270 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.37 
 
 
252 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.4 
 
 
267 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  28.52 
 
 
266 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.52 
 
 
266 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  30.4 
 
 
267 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.08 
 
 
263 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.77 
 
 
249 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.78 
 
 
254 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.31 
 
 
259 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.31 
 
 
259 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.31 
 
 
259 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.31 
 
 
259 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.5 
 
 
261 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.31 
 
 
259 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  28.41 
 
 
278 aa  102  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.12 
 
 
241 aa  102  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5556  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.16 
 
 
274 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  30.24 
 
 
230 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  31.94 
 
 
259 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>