More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1927 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1927  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
264 aa  524  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000008002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2184  Sec-independent protein translocase TatC  79.55 
 
 
264 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0433805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11970  Sec-independent protein translocase TatC  51.18 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0411463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1291  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.75 
 
 
252 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18520  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  43.59 
 
 
275 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0259687  normal  0.019467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.19 
 
 
264 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  normal  0.256476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1883  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.07 
 
 
285 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.048544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.44 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0071  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.5 
 
 
276 aa  198  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445423  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  40.93 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00236204  normal  0.0970018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2061  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.87 
 
 
262 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  0.17357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1822  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.36 
 
 
283 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1779  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.91 
 
 
246 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000101866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16020  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  37.01 
 
 
268 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2320  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.83 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000595398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4452  Sec-independent protein translocase TatC subunit  37.8 
 
 
330 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.108096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2371  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.87 
 
 
317 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1205  Sec-independent protein translocase TatC  34.98 
 
 
278 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0671465  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.68 
 
 
336 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2653  Sec-independent protein translocase TatC  37.07 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2253  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.78 
 
 
316 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0111175  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1768  Sec-independent protein translocase TatC  35.56 
 
 
303 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.708126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  31.18 
 
 
298 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.21 
 
 
296 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  32.84 
 
 
308 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2606  Sec-independent protein translocase TatC  35.09 
 
 
364 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000011186  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2252  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.96 
 
 
362 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.686977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  32.56 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.21 
 
 
326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.21 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.97 
 
 
347 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.47 
 
 
314 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2512  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.58 
 
 
316 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.335803  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2475  Sec-independent protein translocase TatC  33.09 
 
 
316 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2520  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.09 
 
 
316 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2690  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.73 
 
 
324 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  27.31 
 
 
251 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0917  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.05 
 
 
258 aa  115  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.23831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.91 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.13 
 
 
468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  30.68 
 
 
266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.08 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  32.91 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.68 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2170  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.21 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.896493  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.83 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.64 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21950  twin arginine targeting protein translocase subunit TatC  31.5 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288091  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.64 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.48 
 
 
264 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.91 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  28.29 
 
 
266 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0754  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.36 
 
 
250 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0663389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  27.8 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0387  Sec-independent protein translocase TatC  28.99 
 
 
264 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  0.89902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  33.18 
 
 
250 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.48 
 
 
247 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  27.2 
 
 
267 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  27.2 
 
 
267 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.69 
 
 
277 aa  105  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.93 
 
 
253 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.86 
 
 
276 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000249475  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  29.15 
 
 
251 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.93 
 
 
253 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.51 
 
 
250 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.7 
 
 
249 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04641  Tat family protein secretion protein  29.15 
 
 
264 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.174125  normal  0.993499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.96 
 
 
261 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  26.01 
 
 
241 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  30.12 
 
 
269 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.99 
 
 
289 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0075  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.62 
 
 
324 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.96212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.69 
 
 
248 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.28 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.97 
 
 
257 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.28 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.28 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.61 
 
 
398 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.28 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.28 
 
 
259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.23 
 
 
252 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  28.63 
 
 
250 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.63 
 
 
257 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.48 
 
 
254 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  33.06 
 
 
271 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  27.8 
 
 
263 aa  102  7e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  26.95 
 
 
261 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  28.8 
 
 
254 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.94 
 
 
255 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1626  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.01 
 
 
282 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  28.16 
 
 
262 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.59 
 
 
265 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  27.76 
 
 
262 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.12 
 
 
258 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  30.12 
 
 
255 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.14 
 
 
253 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.12 
 
 
258 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.12 
 
 
258 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.49 
 
 
253 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.12 
 
 
258 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>