More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1105 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  80.49 
 
 
248 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.49 
 
 
246 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  40.74 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  40.74 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  39.92 
 
 
247 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  39.92 
 
 
247 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  39.92 
 
 
247 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  39.92 
 
 
247 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.33 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2243  TatCD protein  39.51 
 
 
242 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000509204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  40.09 
 
 
246 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3098  TatCD protein  40.09 
 
 
241 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000196448  hitchhiker  5.70028e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  40.4 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.65 
 
 
264 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.4 
 
 
468 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1021  Sec-independent protein translocase protein tatC  34.73 
 
 
235 aa  162  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.85 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.15 
 
 
259 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  37.1 
 
 
259 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  37.19 
 
 
244 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.73 
 
 
254 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.39 
 
 
257 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.68 
 
 
260 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.87 
 
 
259 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  33.74 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.92 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  35.48 
 
 
252 aa  151  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.16 
 
 
275 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.73 
 
 
324 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  33.2 
 
 
271 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  37.69 
 
 
281 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  30.95 
 
 
266 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  30.56 
 
 
266 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  36.21 
 
 
230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.74 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.03 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.94 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.89 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  31.89 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  33.61 
 
 
258 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.3 
 
 
398 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.13 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  35.48 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.93 
 
 
249 aa  144  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  34.84 
 
 
251 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.07 
 
 
255 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.67 
 
 
268 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  34.44 
 
 
368 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  32.7 
 
 
263 aa  143  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.44 
 
 
339 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  34.31 
 
 
262 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  35.51 
 
 
323 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.58 
 
 
251 aa  142  6e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  37.55 
 
 
270 aa  141  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  34.41 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  34.17 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.92 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.6 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.27 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.27 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.75 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.27 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  30.24 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  30.24 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.35 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  36 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  36 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  36 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  36 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  36 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  36 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  36 
 
 
260 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  33.75 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.2 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.33 
 
 
256 aa  138  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.93 
 
 
250 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.06 
 
 
252 aa  138  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  30.24 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.23 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.23 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.62 
 
 
256 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  32.81 
 
 
265 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.2 
 
 
249 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
261 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.06 
 
 
262 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>