More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1656 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1656  Sec-independent periplasmic protein translocase  100 
 
 
270 aa  533  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.05 
 
 
253 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  52.11 
 
 
251 aa  259  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  48.28 
 
 
247 aa  248  5e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  51.19 
 
 
245 aa  240  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  50.79 
 
 
245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  50 
 
 
245 aa  238  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  50.21 
 
 
241 aa  237  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  48.25 
 
 
247 aa  236  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.15 
 
 
264 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.78 
 
 
468 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  43.7 
 
 
251 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.04 
 
 
257 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.35 
 
 
268 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  40.25 
 
 
271 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.74 
 
 
289 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  35.74 
 
 
289 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  34.1 
 
 
257 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.57 
 
 
252 aa  155  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.36 
 
 
269 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.02 
 
 
254 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.26 
 
 
263 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.55 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.46 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  39.84 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  35.8 
 
 
323 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.49 
 
 
249 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  34.19 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  35.06 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.59 
 
 
259 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.59 
 
 
259 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.59 
 
 
259 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.59 
 
 
259 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.59 
 
 
259 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  33.99 
 
 
266 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.98 
 
 
253 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.66 
 
 
246 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  35.02 
 
 
266 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  32.68 
 
 
261 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  35.83 
 
 
249 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  39.24 
 
 
246 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.3 
 
 
257 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.68 
 
 
266 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  37.9 
 
 
255 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  38.67 
 
 
269 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.1 
 
 
264 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.8 
 
 
258 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  38.43 
 
 
260 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  34.77 
 
 
252 aa  148  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  32.82 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.55 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.55 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3373  Sec-independent protein translocase TatC  38.27 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  33.59 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.09 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.55 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.4 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.13 
 
 
275 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  33.33 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.42 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.16 
 
 
251 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.98 
 
 
258 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.81 
 
 
248 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.81 
 
 
257 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  38.87 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.64 
 
 
251 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.86 
 
 
263 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.78 
 
 
398 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.96 
 
 
274 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.9 
 
 
262 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0843  Sec-independent protein translocase TatC  37.35 
 
 
262 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.293811  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  32.28 
 
 
249 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  36.55 
 
 
262 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.77 
 
 
275 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.14 
 
 
262 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  36.1 
 
 
288 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  32.68 
 
 
249 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.86 
 
 
259 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  34.98 
 
 
250 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  40.44 
 
 
279 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  32.23 
 
 
270 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  32.28 
 
 
249 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.66 
 
 
264 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1211  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
299 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  33.86 
 
 
251 aa  141  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.72 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.14 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0402  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.41 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.26 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.21 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>