More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1619 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1619  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
269 aa  542  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0981488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  58.02 
 
 
281 aa  340  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.65 
 
 
271 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  48.86 
 
 
267 aa  278  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4969  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.45 
 
 
285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000729191  hitchhiker  0.000000000000138567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1460  Sec-independent protein translocase TatC  47.58 
 
 
270 aa  262  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.403826  normal  0.0434954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3820  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.89 
 
 
297 aa  254  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00172839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.74 
 
 
283 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3888  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.42 
 
 
294 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0125  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.31 
 
 
259 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  36.33 
 
 
301 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.64 
 
 
339 aa  185  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  37.69 
 
 
242 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1191  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.54 
 
 
286 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.134243  normal  0.295953 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1220  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.72 
 
 
327 aa  175  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.82 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.45 
 
 
259 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.06 
 
 
257 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.82 
 
 
257 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.31 
 
 
468 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.18 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.66 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  30.68 
 
 
230 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  30.97 
 
 
258 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.8 
 
 
252 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.19 
 
 
259 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  31.85 
 
 
252 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.19 
 
 
259 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.19 
 
 
259 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.19 
 
 
259 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.19 
 
 
259 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  29.74 
 
 
249 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.88 
 
 
261 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.7 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.57 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  33.71 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  32.33 
 
 
251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.45 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.71 
 
 
249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  31.56 
 
 
247 aa  132  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.22 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  29.66 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  28.89 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0402  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.36 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.52 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  33.2 
 
 
368 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.3 
 
 
256 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.88 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.69 
 
 
248 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  36.26 
 
 
241 aa  129  6e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.55 
 
 
253 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  32.45 
 
 
283 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  33.53 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.18 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1120  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.5 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.46 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  31.68 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.37 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  32.75 
 
 
245 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  29.7 
 
 
262 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.86 
 
 
258 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.7 
 
 
262 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  32.75 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  27.55 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  32.08 
 
 
261 aa  125  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.97 
 
 
253 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.2 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  27.78 
 
 
244 aa  125  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.6 
 
 
263 aa  125  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  29.5 
 
 
250 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.07 
 
 
268 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  34.8 
 
 
246 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.4 
 
 
241 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.26 
 
 
266 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  30.77 
 
 
255 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  28.63 
 
 
278 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.78 
 
 
270 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  31.18 
 
 
250 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  29.59 
 
 
271 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.45 
 
 
262 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.43 
 
 
258 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  27.14 
 
 
264 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.43 
 
 
258 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.22 
 
 
277 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  29.43 
 
 
258 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  34.39 
 
 
245 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  31.97 
 
 
262 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.93 
 
 
266 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.92 
 
 
254 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  31.32 
 
 
262 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>