More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1018 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4969  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.53 
 
 
285 aa  255  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000729191  hitchhiker  0.000000000000138567 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  42.4 
 
 
281 aa  250  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.4 
 
 
271 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1619  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  44.74 
 
 
269 aa  234  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0981488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  41.09 
 
 
267 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1460  Sec-independent protein translocase TatC  39.41 
 
 
270 aa  216  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.403826  normal  0.0434954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3888  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.28 
 
 
294 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3820  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.43 
 
 
297 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00172839  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0125  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.55 
 
 
259 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  36.15 
 
 
301 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.64 
 
 
280 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1191  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.25 
 
 
286 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.134243  normal  0.295953 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.47 
 
 
242 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.78 
 
 
339 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.52 
 
 
288 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1220  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.82 
 
 
327 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.6 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.11 
 
 
264 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.13 
 
 
257 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.6 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.16 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.27 
 
 
252 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.88 
 
 
248 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  33.08 
 
 
251 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.58 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  38.25 
 
 
247 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.89 
 
 
257 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.58 
 
 
247 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  35.5 
 
 
283 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  30.22 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  30.22 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  30.22 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  31.87 
 
 
247 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  30.22 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.37 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  30.22 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  29.86 
 
 
247 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  26.37 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.37 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  34.64 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2243  TatCD protein  29.93 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000509204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.45 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  30.56 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.25 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1668  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.17 
 
 
246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  30.12 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.52 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  29.77 
 
 
245 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  30.15 
 
 
245 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.14 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1795  Sec-independent protein translocase TatC  26.56 
 
 
296 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0386851  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.16 
 
 
280 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  30.35 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  31.66 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.93 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  29.2 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0402  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.82 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3592  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.42 
 
 
266 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.89 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  28.52 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  27.31 
 
 
250 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1740  SEC-independent protein translocase  39.29 
 
 
246 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.68 
 
 
261 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3710  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.82 
 
 
266 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.172298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3401  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.82 
 
 
266 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.34 
 
 
268 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  27.48 
 
 
323 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.85 
 
 
241 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  27.6 
 
 
262 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.6 
 
 
262 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  29.09 
 
 
271 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  27.34 
 
 
252 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3098  TatCD protein  30.04 
 
 
241 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000196448  hitchhiker  5.70028e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4241  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.1 
 
 
329 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333798  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.84 
 
 
265 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  29.18 
 
 
270 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.61 
 
 
250 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  27.37 
 
 
262 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  29.77 
 
 
368 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1120  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.53 
 
 
256 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.41 
 
 
266 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  28.29 
 
 
262 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  28.06 
 
 
289 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.06 
 
 
289 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  27.54 
 
 
260 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.29 
 
 
242 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.54 
 
 
257 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1021  Sec-independent protein translocase protein tatC  34.09 
 
 
235 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1345  sec-independent protein translocase  24.77 
 
 
346 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.634552  normal  0.127965 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.36 
 
 
258 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.36 
 
 
258 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  28.36 
 
 
258 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.08 
 
 
260 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.36 
 
 
258 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.23 
 
 
249 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.36 
 
 
258 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.36 
 
 
258 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  28.36 
 
 
258 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>