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for query gene Dfer_3888 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3888  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013730  Slin_4969  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  62.59 
 
 
285 aa  394  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000729191  hitchhiker  0.000000000000138567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  50 
 
 
267 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1460  Sec-independent protein translocase TatC  46.82 
 
 
270 aa  269  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.403826  normal  0.0434954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3820  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  43.96 
 
 
297 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00172839  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  43.54 
 
 
281 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1619  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.42 
 
 
269 aa  244  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0981488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.28 
 
 
283 aa  238  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0283  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.29 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1191  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.25 
 
 
286 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.134243  normal  0.295953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0125  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.28 
 
 
259 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.69 
 
 
280 aa  179  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.91 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  34.31 
 
 
301 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  33.72 
 
 
242 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1220  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.34 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.18 
 
 
288 aa  165  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.21 
 
 
259 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.75 
 
 
261 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.77 
 
 
247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  33.58 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.09 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  33.09 
 
 
283 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  32.84 
 
 
247 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  30.69 
 
 
247 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.21 
 
 
257 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.2 
 
 
246 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2089  TatCD protein  32.23 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  32.23 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  32.23 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  30.69 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  30.74 
 
 
230 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  31.41 
 
 
323 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.34 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2243  TatCD protein  32.34 
 
 
242 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000509204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  32 
 
 
271 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0982  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.08 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.53 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  30.48 
 
 
247 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  32.41 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.36 
 
 
268 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3258  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.74 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  32.48 
 
 
263 aa  126  3e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1120  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.53 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.84 
 
 
242 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3098  TatCD protein  32.53 
 
 
241 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000196448  hitchhiker  5.70028e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.23 
 
 
263 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.36 
 
 
262 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.36 
 
 
262 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.31 
 
 
324 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  31.4 
 
 
256 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.44 
 
 
252 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  30.27 
 
 
247 aa  123  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1981  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.74 
 
 
287 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.437038  normal  0.0428943 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  31.72 
 
 
264 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.96 
 
 
266 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.37 
 
 
251 aa  122  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.32 
 
 
468 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  32.97 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  29.85 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.12 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  28.29 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  30.62 
 
 
241 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  27.91 
 
 
245 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  28.9 
 
 
268 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.9 
 
 
268 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.21 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  28.84 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  28.68 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  30.65 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.17 
 
 
336 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  31.6 
 
 
249 aa  119  7.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  28.47 
 
 
270 aa  119  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2762  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.96 
 
 
266 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0340743  normal  0.092649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.47 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  28.47 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.66 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.41 
 
 
246 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.64 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  29.76 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
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NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.22 
 
 
264 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  29.18 
 
 
266 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.37 
 
 
263 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  32.97 
 
 
368 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  27.31 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
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NC_010001  Cphy_0402  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.92 
 
 
268 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  31.18 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.89 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.43 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  29.01 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.52 
 
 
368 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  29.39 
 
 
262 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.037642 
 
 
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NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.94 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  28.25 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.31 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
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NC_014148  Plim_2680  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.5 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.467706  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.4 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  28.25 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  28.25 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
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