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for query gene Plim_2680 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2680  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 		 389 aa  794    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.467706  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0991  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  42.33 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395989  hitchhiker  0.000851053 
 
 
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NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.74 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
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NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  39.11 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
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NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.12 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
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NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.34 
 
 		 468 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008751  Dvul_1952  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.51 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
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NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.55 
 
 		 249 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_1889  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  40.98 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.824369  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  38.37 
 
 		 270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.37 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0078  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.37 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_2680  Sec-independent protein translocase TatC  40.46 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009715  CCV52592_1575  twin arginine-targeting protein translocase TatC  38.73 
 
 		 247 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.58 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2494  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  41.67 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  34.8 
 
 		 283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.55 
 
 		 248 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  38.25 
 
 		 241 aa  126  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.76 
 
 		 242 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039082 
 
 
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NC_011831  Cagg_0210  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.52 
 
 		 261 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.83 
 
 		 268 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  35.83 
 
 		 268 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.58 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0606  Sec-independent protein translocase TatC  36.51 
 
 		 245 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_0982  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.71 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_1965  Sec-independent protein translocase TatC  37.43 
 
 		 256 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
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NC_003912  CJE0681  Sec-independent protein translocase TatC  35.45 
 
 		 245 aa  122  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  37.11 
 
 		 250 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
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NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  35.75 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.17 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  37.99 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_1091  Sec-independent protein translocase TatC  35.8 
 
 		 245 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.379289  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  37 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.63 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  37.63 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
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NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.07 
 
 		 259 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_3258  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.27 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.39 
 
 		 259 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5858  sec-independent protein translocase TatC  40.83 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.36 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
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NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  35.98 
 
 		 270 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.67 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.55 
 
 		 261 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
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NC_008255  CHU_3632  Sec-independent protein translocase TatC  38.01 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.55 
 
 		 261 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0094  Sec-independent protein translocase TatC  34.16 
 
 		 250 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0230182  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  35.38 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
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NC_013385  Adeg_1229  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.95 
 
 		 246 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.672441  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_1268  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  37.11 
 
 		 250 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  36.04 
 
 		 263 aa  114  4.0000000000000004e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  39.15 
 
 		 249 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
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NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  38.55 
 
 		 260 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.48 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  35.16 
 
 		 230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.08 
 
 		 264 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0754  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.23 
 
 		 250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0663389  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  33.8 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  33.33 
 
 		 247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.8 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.8 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.59 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.59 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.59 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.59 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_2958  Sec-independent protein translocase TatC  34.39 
 
 		 263 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.666331  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  36.16 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  35.59 
 
 		 259 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  36.16 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  30.69 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  38.17 
 
 		 258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3029  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.26 
 
 		 272 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
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NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.02 
 
 		 258 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.19 
 
 		 280 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3820  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.97 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00172839  normal  1 
 
 
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NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.73 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.65 
 
 		 263 aa  109  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  30.56 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  34.44 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.53 
 
 		 280 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  29.1 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  34.55 
 
 		 269 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1486  MttB family protein  31.9 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255832  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3888  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.5 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  35.11 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.27 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  31.64 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  34.72 
 
 		 262 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.72 
 
 		 262 aa  107  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183813  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 		 263 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_1606  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.94 
 
 		 249 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1617  Sec-independent protein translocase TatC  33.91 
 
 		 271 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.050313  normal  1 
 
 
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