More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4241 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4241  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  100 
 
 
329 aa  664    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333798  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.6 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1889  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.71 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.824369  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.72 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1119  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.5 
 
 
241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1092  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.48 
 
 
241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12353  putative Sec-independent protein translocase component  29.43 
 
 
281 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.57 
 
 
258 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.57 
 
 
258 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  34.57 
 
 
258 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.52 
 
 
255 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.52 
 
 
249 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.1 
 
 
283 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  33.33 
 
 
259 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0063  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.36 
 
 
270 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0346056  normal  0.0538922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  33.52 
 
 
250 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.69 
 
 
468 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.12 
 
 
259 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.85 
 
 
260 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  38.24 
 
 
266 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0127  Sec-independent protein translocase TatC  34.24 
 
 
263 aa  103  3e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.87 
 
 
262 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.09 
 
 
398 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  33.87 
 
 
262 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.87 
 
 
262 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.14 
 
 
259 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0987  Sec-independent protein translocase TatC  34.02 
 
 
301 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1453  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.99 
 
 
253 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.381621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  35.2 
 
 
249 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0452  MttB family protein  34.78 
 
 
253 aa  102  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36 
 
 
249 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  33.7 
 
 
230 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.97 
 
 
264 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  31.87 
 
 
249 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  36.42 
 
 
264 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0681  sec-independent protein translocase protein TatC  33.89 
 
 
283 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000821362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1771  Sec-independent protein translocase TatC  32.62 
 
 
323 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.84 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  33.7 
 
 
262 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.87 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  32.42 
 
 
253 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.87 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.87 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.87 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.87 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03838  twin arginine-targeting protein translocase TatC  34.29 
 
 
251 aa  99.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362627  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1145  Sec-independent protein translocase TatC  33.15 
 
 
269 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.504761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.7 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.114268  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.72 
 
 
261 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.64 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.72 
 
 
261 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.88 
 
 
260 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  33.52 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1459  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.77 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.628358  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  30.27 
 
 
255 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.98 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.22 
 
 
258 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.41 
 
 
247 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1102  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.91 
 
 
339 aa  96.3  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.462043  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.05 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2541  twin-arginine translocation system protein, TatC  30.65 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1201  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.65 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0527172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2608  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.09 
 
 
263 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  31.25 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  28.26 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.35 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0964  Sec-independent periplasmic protein translocase  32.81 
 
 
242 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  30.22 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1120  twin arginine-targeting protein translocase TatC  31.52 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000124349  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  31.43 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1535  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.27 
 
 
280 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0470  twin-arginine translocating C- subunit  32.58 
 
 
250 aa  94  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.018127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1166  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.43 
 
 
280 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1968  Sec-independent protein translocase TatC  33.16 
 
 
270 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1804  Sec-independent protein translocase TatC  29.74 
 
 
288 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0402  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.79 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  30.96 
 
 
247 aa  93.2  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0560  Sec-independent protein translocase protein TatC  32.04 
 
 
249 aa  92.8  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0570842  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0663  Sec-independent protein secretion pathway component TatC  29.26 
 
 
247 aa  93.2  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  34.68 
 
 
254 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  29.94 
 
 
250 aa  92.4  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3928  Sec-independent protein translocase TatC  34.81 
 
 
255 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.07 
 
 
277 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0066  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.38 
 
 
268 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0061  Sec-independent protein translocase TatC  31.38 
 
 
270 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.99244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  28.49 
 
 
251 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2185  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.87 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0909  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.26 
 
 
280 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12711  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  32.07 
 
 
269 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1656  Sec-independent periplasmic protein translocase  36.57 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1096  Sec-independent protein translocase TatC  32.61 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>