More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0998 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0998  Sec-independent periplasmic protein translocase  100 
 
 
598 aa  1182    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1032  Sec-independent periplasmic protein translocase  45.83 
 
 
561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.983236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2609  Sec-independent periplasmic protein translocase  46.75 
 
 
360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116884  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0168  Sec-independent periplasmic protein translocase  47.46 
 
 
324 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2051  Sec-independent periplasmic protein translocase  54.02 
 
 
381 aa  284  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2547  sec-independent protein translocase, protein  34.43 
 
 
260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.2 
 
 
250 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.97 
 
 
398 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.34 
 
 
251 aa  98.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.44 
 
 
260 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  31.2 
 
 
278 aa  97.1  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.18 
 
 
248 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.93 
 
 
253 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.85 
 
 
468 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  30.67 
 
 
294 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  29.05 
 
 
264 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.1 
 
 
251 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.1 
 
 
251 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.1 
 
 
251 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.1 
 
 
251 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.26 
 
 
314 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.35 
 
 
246 aa  94  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.51 
 
 
255 aa  94  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  27.54 
 
 
261 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  29.17 
 
 
267 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.4 
 
 
336 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0716  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.21 
 
 
289 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.71 
 
 
249 aa  92  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  28.63 
 
 
250 aa  92  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  28.33 
 
 
255 aa  92  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  29.17 
 
 
267 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2322  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.43 
 
 
277 aa  92  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0472235  normal  0.432389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.39 
 
 
316 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  29.1 
 
 
249 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.98 
 
 
257 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.66 
 
 
368 aa  90.9  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.31 
 
 
258 aa  90.5  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  29.29 
 
 
249 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  28.28 
 
 
249 aa  89.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.52 
 
 
247 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  27.8 
 
 
251 aa  89.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  25.52 
 
 
247 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  25.52 
 
 
247 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  26.58 
 
 
368 aa  89  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  27.43 
 
 
247 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  28.9 
 
 
285 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.8 
 
 
261 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  27.23 
 
 
266 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  27.31 
 
 
266 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  29.06 
 
 
266 aa  89  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  31.8 
 
 
261 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2089  TatCD protein  25.1 
 
 
247 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  25.1 
 
 
247 aa  88.2  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.27 
 
 
247 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  25.1 
 
 
247 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.76 
 
 
258 aa  88.2  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.8 
 
 
275 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.8 
 
 
275 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  25.1 
 
 
247 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.76 
 
 
258 aa  87.4  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.76 
 
 
258 aa  87.4  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  26.92 
 
 
257 aa  87  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.92 
 
 
264 aa  87  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1504  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.27 
 
 
296 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  hitchhiker  0.00228541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  27.9 
 
 
253 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.53 
 
 
260 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.26 
 
 
269 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.82 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.09 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  32.69 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2752  Sec-independent protein translocase TatC  32.69 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3252  Sec-independent protein translocase TatC  32.69 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0816  Sec-independent protein translocase TatC  33.55 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.397111  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3653  Sec-independent protein translocase TatC  32.69 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  32.69 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.8 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  32.69 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.18 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  32.69 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.18 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.18 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.38 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.64 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  30.64 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  30.38 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.18 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.18 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.38 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  24.69 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.22 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.219215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.52 
 
 
259 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  29.27 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0708  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.33 
 
 
267 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2980  Sec-independent protein translocase TatC  32.21 
 
 
260 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.48 
 
 
347 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477379  hitchhiker  0.00159112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  26.77 
 
 
250 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  29.58 
 
 
254 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  28.1 
 
 
249 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  26.61 
 
 
265 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  29.51 
 
 
270 aa  82.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>