More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2609 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2609  Sec-independent periplasmic protein translocase  100 
 
 		 360 aa  719    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0116884  normal  0.506463 
 
 
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NC_013158  Huta_1032  Sec-independent periplasmic protein translocase  46.41 
 
 		 561 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.983236  n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_0998  Sec-independent periplasmic protein translocase  56.27 
 
 		 598 aa  299  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013922  Nmag_2051  Sec-independent periplasmic protein translocase  55.6 
 
 		 381 aa  294  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
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NC_013743  Htur_0168  Sec-independent periplasmic protein translocase  46.15 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A2547  sec-independent protein translocase, protein  33.33 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.68893 
 
 
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NC_008554  Sfum_0692  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.87 
 
 		 257 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.299574  normal  0.13691 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  32.52 
 
 		 266 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1808  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.81 
 
 		 468 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4868  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.46 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145706  normal  0.0727034 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  27.68 
 
 		 266 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  27.68 
 
 		 266 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1687  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.48 
 
 		 275 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1105  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.15 
 
 		 247 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.06 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3363  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.16 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00118614  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1489  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.8 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299654  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.76 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5556  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.63 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1429  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.56 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.219215 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1646  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.53 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000520581  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1481  sec-independent protein translocase TatC  25.44 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.5 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  28.18 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  28.18 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  26.91 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.33 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000685633  n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4349  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.05 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4289  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.05 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_3171  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.92 
 
 		 257 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000130103  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1907  Sec-independent protein translocase TatC  27.39 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.712329 
 
 
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NC_002936  DET1599  Sec-independent protein translocase TatC  25.44 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144124  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2273  TatCD protein  25.76 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231402  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2355  TatCD protein  25.76 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_3986  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.94 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786755 
 
 
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NC_011769  DvMF_3123  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.87 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290973 
 
 
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NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  27.31 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2089  TatCD protein  24.89 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000492814  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2029  sec-independent protein translocase  24.89 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711776  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  23.97 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_2666  SEC-independent protein translocase protein  29.03 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2270  TatCD protein  24.89 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29917e-36 
 
 
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NC_013441  Gbro_2469  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  33.09 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  30.12 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  30.12 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
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NC_008312  Tery_1812  Sec-independent protein translocase TatC  26.57 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00710402  hitchhiker  0.000512966 
 
 
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NC_007644  Moth_1279  Sec-independent protein translocase TatC  26.05 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00382682  hitchhiker  0.0000030225 
 
 
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NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  29.6 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_0816  Sec-independent protein translocase TatC  29.7 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.397111  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1345  Sec-independent protein translocase TatC  25.11 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.352913  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.6 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_1468  Sec-independent protein translocase TatC  23.9 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0443024  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_1648  Sec-independent protein translocase TatC subunit  28.75 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.889374  normal  0.775043 
 
 
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NC_006274  BCZK2027  sec-independent protein translocase  24.45 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_3094  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  32.89 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.643996 
 
 
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NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.76 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0956  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.46 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  26.88 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_03800  Twin arginine targeting translocation protein , TatC subunit  24.14 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0227  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.14 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000248911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.4 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0708  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.09 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  27.17 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  25.7 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1640  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.52 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.92 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  26.36 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1578  Sec-independent protein translocase TatC  26.38 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12128  sec-independent protein translocase transmembrane protein tatC  27.49 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610432  normal  0.629403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  26.72 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.9 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.9 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3987  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.92 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.9 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  24.9 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0386  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  28.85 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.565784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  23.87 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  26.63 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.4 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1226  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.35 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25.4 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1475  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.85 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000005557  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2343  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  29.46 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0131452  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  25.9 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
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NC_008726  Mvan_3441  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.63 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.404455  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2226  TatCD protein  24.02 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000435939  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  24.5 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3711  Sec-independent protein translocase TatC  30.89 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2701  Sec-independent protein translocase TatC  30.89 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3680  Sec-independent protein translocase TatC  30.89 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.607008  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_3050  Sec-independent protein translocase TatC  27.31 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_2659  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  27.31 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  25 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1801  Sec-independent protein translocase TatC  30.89 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  24.8 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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