163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0137 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1519 aa  3008    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.72 
 
 		 1227 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.98 
 
 		 1119 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.68 
 
 		 1029 aa  347  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.41 
 
 		 919 aa  341  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  34.49 
 
 		 2365 aa  318  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  34.49 
 
 		 2346 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  35.74 
 
 		 2396 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.72 
 
 		 2003 aa  300  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.02 
 
 		 972 aa  294  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  33.84 
 
 		 2366 aa  294  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  33.84 
 
 		 2371 aa  292  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  32.89 
 
 		 650 aa  291  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  31.55 
 
 		 1550 aa  291  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  31.4 
 
 		 3506 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  32.35 
 
 		 995 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  30.98 
 
 		 986 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.62 
 
 		 1285 aa  261  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  31.53 
 
 		 1782 aa  260  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29 
 
 		 1881 aa  256  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.06 
 
 		 1848 aa  254  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  32.49 
 
 		 1164 aa  249  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.84 
 
 		 1011 aa  240  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  29.76 
 
 		 3954 aa  239  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  29.5 
 
 		 4238 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  29.58 
 
 		 1056 aa  236  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  29.5 
 
 		 4238 aa  235  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  29.5 
 
 		 3822 aa  235  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  32.16 
 
 		 995 aa  222  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  32.04 
 
 		 991 aa  221  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  31.2 
 
 		 1333 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.48 
 
 		 1001 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.12 
 
 		 1033 aa  206  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  30.18 
 
 		 677 aa  205  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  29.53 
 
 		 983 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  28.6 
 
 		 1004 aa  202  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.11 
 
 		 1055 aa  201  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  28.91 
 
 		 1001 aa  201  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  31.93 
 
 		 1062 aa  197  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  27.65 
 
 		 990 aa  190  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.21 
 
 		 1125 aa  190  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  32.37 
 
 		 1016 aa  188  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  28.64 
 
 		 1006 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  30.38 
 
 		 1038 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  29.43 
 
 		 1028 aa  181  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  27.81 
 
 		 1130 aa  180  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  27.91 
 
 		 1129 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  27.91 
 
 		 1129 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  27.91 
 
 		 1131 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  27.91 
 
 		 1131 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  27.91 
 
 		 1131 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  27.91 
 
 		 1131 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  27.43 
 
 		 2711 aa  172  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  27.91 
 
 		 1131 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.53 
 
 		 1081 aa  167  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.93 
 
 		 980 aa  166  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  29.94 
 
 		 1011 aa  159  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  30.76 
 
 		 1053 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 		 1152 aa  149  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.72 
 
 		 1532 aa  140  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  28.04 
 
 		 985 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  28.29 
 
 		 1769 aa  125  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.51 
 
 		 1489 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  38.43 
 
 		 2578 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  28.72 
 
 		 994 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  48.57 
 
 		 2926 aa  111  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  23.61 
 
 		 1180 aa  108  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  27.2 
 
 		 816 aa  103  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  28.24 
 
 		 1459 aa  103  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  42.61 
 
 		 2906 aa  103  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.9 
 
 		 1593 aa  103  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  23.5 
 
 		 2407 aa  102  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  24.03 
 
 		 1078 aa  99.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  27.59 
 
 		 488 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  33.64 
 
 		 1530 aa  93.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  25.45 
 
 		 1019 aa  93.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.51 
 
 		 915 aa  92.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  26.5 
 
 		 407 aa  92  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  27.61 
 
 		 1458 aa  91.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  24.71 
 
 		 814 aa  91.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.11 
 
 		 926 aa  88.6  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  42.42 
 
 		 1861 aa  88.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.99 
 
 		 774 aa  87.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  38.06 
 
 		 987 aa  85.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  23.55 
 
 		 1111 aa  85.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.3 
 
 		 913 aa  84.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.44 
 
 		 3629 aa  82  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.43 
 
 		 1322 aa  81.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  39.29 
 
 		 1741 aa  80.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  37.91 
 
 		 3420 aa  80.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  32.88 
 
 		 1130 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.97 
 
 		 910 aa  75.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  31.33 
 
 		 882 aa  72.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  27.75 
 
 		 860 aa  72  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  25.8 
 
 		 959 aa  70.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24 
 
 		 1369 aa  70.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.29 
 
 		 1694 aa  70.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  48.42 
 
 		 1882 aa  68.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  37.42 
 
 		 1068 aa  65.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1488  autotransporter (AT) family porin  29.15 
 
 		 1951 aa  63.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>