11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1973 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01638  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  520  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.992206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1973  conserved hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00561956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01628  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  520  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1528  hypothetical protein  99.61 
 
 
270 aa  516  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000725408  hitchhiker  0.0000459629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1884  hypothetical protein  99.21 
 
 
270 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000419061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1962  hypothetical protein  99.21 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2382  hypothetical protein  99.21 
 
 
270 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000742969  hitchhiker  0.00107532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1869  hypothetical protein  98.43 
 
 
270 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0282  hypothetical protein  35.54 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.307427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  25.87 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3035  hypothetical protein  24.55 
 
 
676 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>