55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3871 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  61.55 
 
 		 793 aa  765    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  100 
 
 		 1159 aa  2259    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  72.63 
 
 		 1597 aa  364  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  83.81 
 
 		 1708 aa  350  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  53.39 
 
 		 406 aa  339  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  54.6 
 
 		 401 aa  331  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  48.37 
 
 		 364 aa  262  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  48.51 
 
 		 309 aa  260  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  46.76 
 
 		 433 aa  249  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  47.39 
 
 		 369 aa  228  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  46.03 
 
 		 318 aa  226  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  45.8 
 
 		 339 aa  206  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  60.8 
 
 		 1394 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3035  hypothetical protein  40.25 
 
 		 676 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  32.69 
 
 		 4357 aa  79  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  53.39 
 
 		 675 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.11 
 
 		 830 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  51.95 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.67 
 
 		 6678 aa  62.4  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  39.22 
 
 		 916 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  56.98 
 
 		 455 aa  60.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  25.32 
 
 		 3907 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.08 
 
 		 11716 aa  59.3  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  32.24 
 
 		 786 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2928  hypothetical protein  30.08 
 
 		 678 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000841145  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1054 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  35.03 
 
 		 674 aa  54.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  63.64 
 
 		 456 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  38.51 
 
 		 942 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4658  mucin 2  60.87 
 
 		 794 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0296531  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  27.94 
 
 		 756 aa  53.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  27.94 
 
 		 756 aa  53.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  27.94 
 
 		 756 aa  53.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2559  hypothetical protein  30.07 
 
 		 297 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3449  hypothetical protein  31.97 
 
 		 491 aa  52.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 		 3699 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  35.44 
 
 		 1142 aa  52.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.64 
 
 		 2313 aa  52  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 		 3699 aa  52  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.1 
 
 		 2503 aa  52  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  27.09 
 
 		 2223 aa  51.6  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.28 
 
 		 4761 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1367 aa  49.7  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  29.24 
 
 		 1265 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1916 aa  48.9  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2979  hypothetical protein  53.01 
 
 		 344 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.32 
 
 		 598 aa  47.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  48 
 
 		 521 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  29.77 
 
 		 1735 aa  46.2  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  23.35 
 
 		 1565 aa  45.8  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.26 
 
 		 598 aa  45.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.3 
 
 		 265 aa  44.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1218 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  53.12 
 
 		 812 aa  44.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>