27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3963 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  81.29 
 
 		 364 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  79.87 
 
 		 318 aa  461  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  75.95 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  59 
 
 		 406 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  55.94 
 
 		 401 aa  275  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  50 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  48.06 
 
 		 1159 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  49.65 
 
 		 793 aa  260  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  47.48 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  34.17 
 
 		 4357 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  31.82 
 
 		 1597 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  36.27 
 
 		 1708 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.76 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1699 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  27.85 
 
 		 3907 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  27.95 
 
 		 2503 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  27.83 
 
 		 3699 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1504 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.07 
 
 		 3699 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  23.46 
 
 		 6678 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  25 
 
 		 1265 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  34 
 
 		 1565 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  30.69 
 
 		 911 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  27.78 
 
 		 1310 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1737  hypothetical protein  28.41 
 
 		 251 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000179479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  27.2 
 
 		 2223 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>