33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4731 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  100 
 
 		 2223 aa  4510    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.42 
 
 		 6678 aa  73.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2001  phosphoesterase  44.19 
 
 		 626 aa  71.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.89 
 
 		 3699 aa  62  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  28.89 
 
 		 2503 aa  61.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  27.78 
 
 		 3699 aa  60.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  30.47 
 
 		 1597 aa  58.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.2 
 
 		 1035 aa  58.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.77 
 
 		 4761 aa  55.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1265 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5052  hypothetical protein  40.57 
 
 		 511 aa  55.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2801  phosphoesterase  37.66 
 
 		 816 aa  55.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  28.96 
 
 		 1708 aa  53.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  27.09 
 
 		 1159 aa  52.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  26.97 
 
 		 747 aa  52.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.6 
 
 		 739 aa  51.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  25.64 
 
 		 1310 aa  51.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  26.14 
 
 		 686 aa  51.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  28.57 
 
 		 369 aa  50.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.51 
 
 		 11716 aa  50.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  27.6 
 
 		 739 aa  50.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  32.58 
 
 		 306 aa  50.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1367 aa  49.7  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14743  predicted protein  29.32 
 
 		 1900 aa  49.7  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  28.64 
 
 		 2374 aa  48.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  36.97 
 
 		 981 aa  47.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  26 
 
 		 643 aa  47.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  32 
 
 		 793 aa  47  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  31.29 
 
 		 767 aa  47.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  29.78 
 
 		 318 aa  47  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  30.65 
 
 		 2066 aa  46.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0014  hypothetical protein  29 
 
 		 533 aa  45.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.224156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.11 
 
 		 594 aa  45.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>