55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3863 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  100 
 
 		 1708 aa  3326    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  84.41 
 
 		 1597 aa  869    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  56.18 
 
 		 1746 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  50.38 
 
 		 1059 aa  477  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  54.62 
 
 		 1159 aa  460  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  49.44 
 
 		 1332 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  50.61 
 
 		 793 aa  220  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  35.64 
 
 		 433 aa  107  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0809  laminin G, domain-containing 2  42.15 
 
 		 209 aa  90.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.012094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  33 
 
 		 406 aa  88.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  33.5 
 
 		 318 aa  83.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  34.45 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  36.21 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  30.34 
 
 		 339 aa  81.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  33.2 
 
 		 364 aa  72  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  30.96 
 
 		 401 aa  72  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  27.56 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_89632  predicted protein  29.96 
 
 		 357 aa  68.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.730848  hitchhiker  0.00000161673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  27.84 
 
 		 299 aa  68.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  44.54 
 
 		 735 aa  65.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  30.46 
 
 		 786 aa  62.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  50 
 
 		 1394 aa  60.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.29 
 
 		 6678 aa  60.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2928  hypothetical protein  26.84 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000841145  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  27.66 
 
 		 304 aa  60.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 		 11716 aa  58.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  26.27 
 
 		 307 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1054 aa  56.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0404  type 3a, cellulose-binding  37.29 
 
 		 522 aa  53.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0894635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  29.44 
 
 		 2223 aa  53.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  40.28 
 
 		 551 aa  52.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2260  hypothetical protein  28.36 
 
 		 319 aa  52.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46285  normal  0.598138 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  39.26 
 
 		 617 aa  52.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  51.28 
 
 		 830 aa  52  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  52.94 
 
 		 942 aa  50.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  29.27 
 
 		 4357 aa  49.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  34.55 
 
 		 407 aa  49.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  23.89 
 
 		 2503 aa  49.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  49.41 
 
 		 521 aa  48.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  23.89 
 
 		 3699 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  23.97 
 
 		 307 aa  47.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3515  hypothetical protein  38.46 
 
 		 954 aa  47.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  39.38 
 
 		 671 aa  48.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  25.37 
 
 		 756 aa  47  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  25.37 
 
 		 756 aa  47  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  44.32 
 
 		 259 aa  47  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  25.37 
 
 		 756 aa  47  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  43.33 
 
 		 555 aa  47  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  29.22 
 
 		 268 aa  47  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  58.46 
 
 		 854 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.33 
 
 		 3699 aa  47  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  50 
 
 		 453 aa  46.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.95 
 
 		 261 aa  46.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1265 aa  45.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44 
 
 		 470 aa  45.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>