20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3169 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  688    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  67.57 
 
 		 433 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  49.83 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  50.55 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  49.13 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  50.74 
 
 		 369 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  47.15 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  44.4 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  42.91 
 
 		 793 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  45.8 
 
 		 1159 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  31.38 
 
 		 1597 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  30.42 
 
 		 1708 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  35.9 
 
 		 4357 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  27.27 
 
 		 3907 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  32.69 
 
 		 911 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.43 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1699 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1265 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  31.87 
 
 		 1310 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.92 
 
 		 1967 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>