More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1877 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  100 
 
 		 1699 aa  3284    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  39.31 
 
 		 4854 aa  222  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  33.58 
 
 		 5218 aa  161  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  52.74 
 
 		 3314 aa  154  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  44.27 
 
 		 1428 aa  150  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.86 
 
 		 3396 aa  150  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  29.13 
 
 		 4848 aa  137  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  41.5 
 
 		 1166 aa  133  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.63 
 
 		 5839 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  37.83 
 
 		 6753 aa  127  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.54 
 
 		 3363 aa  125  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.34 
 
 		 5962 aa  125  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  36.96 
 
 		 8682 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  36.96 
 
 		 9030 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  25.37 
 
 		 2353 aa  119  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  27.38 
 
 		 3474 aa  116  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  54.92 
 
 		 2704 aa  116  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  43.17 
 
 		 1598 aa  116  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1504 aa  115  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.85 
 
 		 4836 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  51.16 
 
 		 4106 aa  111  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.87 
 
 		 2839 aa  110  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  42.33 
 
 		 6779 aa  109  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  30.43 
 
 		 16311 aa  108  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.33 
 
 		 6683 aa  108  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  42.33 
 
 		 6662 aa  108  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27.16 
 
 		 1597 aa  108  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.33 
 
 		 2239 aa  108  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  42.86 
 
 		 542 aa  105  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.79 
 
 		 2812 aa  105  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  41.21 
 
 		 8321 aa  104  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  44.75 
 
 		 4285 aa  105  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  45.35 
 
 		 3184 aa  104  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.26 
 
 		 5787 aa  104  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.72 
 
 		 1884 aa  103  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  30.82 
 
 		 9867 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  41.24 
 
 		 4214 aa  101  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  49.28 
 
 		 2452 aa  100  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  46.71 
 
 		 1883 aa  100  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.92 
 
 		 4220 aa  100  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  43.83 
 
 		 2542 aa  98.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  40 
 
 		 1350 aa  97.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  42.35 
 
 		 5442 aa  97.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  45.03 
 
 		 4678 aa  96.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  31.1 
 
 		 6211 aa  95.5  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  40.2 
 
 		 2768 aa  95.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.47 
 
 		 588 aa  94.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28.35 
 
 		 2767 aa  93.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  28.57 
 
 		 3477 aa  92.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  46.4 
 
 		 709 aa  91.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  35.63 
 
 		 7149 aa  91.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  29.15 
 
 		 3191 aa  90.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  54.08 
 
 		 2678 aa  90.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  43.71 
 
 		 686 aa  90.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  48.76 
 
 		 5171 aa  89.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  45.16 
 
 		 2251 aa  89.4  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  40.54 
 
 		 1538 aa  89.4  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  57.14 
 
 		 867 aa  89  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.11 
 
 		 4122 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.08 
 
 		 1372 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  27.37 
 
 		 2074 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.47 
 
 		 4978 aa  87.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.32 
 
 		 1553 aa  86.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.69 
 
 		 813 aa  86.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  37.25 
 
 		 4791 aa  86.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.49 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  44.09 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  48.18 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  34.24 
 
 		 2743 aa  84.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.94 
 
 		 2067 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  62.82 
 
 		 421 aa  84.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  47.27 
 
 		 475 aa  84  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  39.05 
 
 		 946 aa  84.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1424 aa  83.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  52.58 
 
 		 1383 aa  83.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  49.15 
 
 		 3619 aa  83.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  49.15 
 
 		 3619 aa  83.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  43.75 
 
 		 2329 aa  83.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.37 
 
 		 1963 aa  83.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  47.06 
 
 		 1022 aa  83.2  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  47.06 
 
 		 1017 aa  82.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  55 
 
 		 4798 aa  82.8  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 1016 aa  82.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  29.9 
 
 		 16322 aa  82  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  53.19 
 
 		 1019 aa  81.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  53.06 
 
 		 556 aa  81.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  28.84 
 
 		 2816 aa  81.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  57.32 
 
 		 2911 aa  81.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  32.16 
 
 		 2336 aa  81.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  59.21 
 
 		 942 aa  81.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  45.74 
 
 		 518 aa  81.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  49.54 
 
 		 313 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  50.46 
 
 		 313 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  49.02 
 
 		 303 aa  80.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45.71 
 
 		 517 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  48.94 
 
 		 1499 aa  80.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  42.65 
 
 		 1202 aa  80.5  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  54.43 
 
 		 161 aa  80.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.69 
 
 		 814 aa  80.1  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>