More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1361 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 2329 aa  4600    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.47 
 
 		 5098 aa  585  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  28 
 
 		 4748 aa  370  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  25.3 
 
 		 7233 aa  272  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.6 
 
 		 4876 aa  229  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1538 aa  124  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 4334 aa  110  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.86 
 
 		 3314 aa  107  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  48.63 
 
 		 1141 aa  105  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.57 
 
 		 3427 aa  102  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.71 
 
 		 3619 aa  101  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.36 
 
 		 3619 aa  100  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  39.55 
 
 		 824 aa  99.8  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1424 aa  99.4  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 		 709 aa  98.6  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  39.55 
 
 		 942 aa  97.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  45.8 
 
 		 2667 aa  96.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  46.36 
 
 		 813 aa  95.9  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.47 
 
 		 11716 aa  95.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  42.24 
 
 		 303 aa  94.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  33.48 
 
 		 2537 aa  93.6  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.04 
 
 		 1236 aa  92.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.22 
 
 		 2885 aa  92  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.81 
 
 		 867 aa  91.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.93 
 
 		 3608 aa  90.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.05 
 
 		 1963 aa  90.9  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.09 
 
 		 421 aa  90.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  39.33 
 
 		 1712 aa  90.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 588 aa  90.5  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.25 
 
 		 833 aa  90.1  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44 
 
 		 1164 aa  89.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  46.79 
 
 		 795 aa  89.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  39.33 
 
 		 2775 aa  89.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  46.49 
 
 		 2105 aa  88.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.49 
 
 		 1795 aa  88.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  49.51 
 
 		 1279 aa  87.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1526 aa  87.4  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  44.17 
 
 		 950 aa  87.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  47.42 
 
 		 757 aa  87.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  45.05 
 
 		 686 aa  86.7  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  35.43 
 
 		 1855 aa  85.9  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  42.61 
 
 		 2784 aa  85.9  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  49.09 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  54.12 
 
 		 589 aa  85.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.4 
 
 		 485 aa  85.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.87 
 
 		 5839 aa  85.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  52.13 
 
 		 4687 aa  85.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  43.22 
 
 		 686 aa  85.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 		 424 aa  84.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 982 aa  84.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.96 
 
 		 946 aa  84  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  49.56 
 
 		 202 aa  84  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  49.56 
 
 		 202 aa  84  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  39.16 
 
 		 959 aa  84  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  45.3 
 
 		 1814 aa  84  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  58.44 
 
 		 855 aa  83.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  39.18 
 
 		 1306 aa  83.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  45.76 
 
 		 219 aa  83.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  53.61 
 
 		 1156 aa  83.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  53.33 
 
 		 1499 aa  83.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  40 
 
 		 219 aa  83.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 361 aa  83.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  46.43 
 
 		 1175 aa  83.2  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.27 
 
 		 1016 aa  83.2  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1699 aa  82.8  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.51 
 
 		 2678 aa  82.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  36.89 
 
 		 1421 aa  82.4  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.16 
 
 		 4798 aa  82.4  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  41.54 
 
 		 5171 aa  82  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  43.08 
 
 		 1532 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.6 
 
 		 2668 aa  82  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  36.36 
 
 		 582 aa  81.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  45.05 
 
 		 679 aa  82  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 		 1534 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  43.59 
 
 		 606 aa  81.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  46.03 
 
 		 518 aa  81.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  44.86 
 
 		 572 aa  81.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  47.75 
 
 		 1363 aa  81.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  45.63 
 
 		 2145 aa  81.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  42.37 
 
 		 615 aa  80.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.45 
 
 		 1372 aa  80.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  39.47 
 
 		 709 aa  80.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  51.25 
 
 		 2251 aa  80.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 		 1383 aa  80.5  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  46.79 
 
 		 1287 aa  80.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  45.69 
 
 		 280 aa  79.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  49.53 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  39.16 
 
 		 860 aa  78.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  34.59 
 
 		 2452 aa  78.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  39.39 
 
 		 361 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 767 aa  79  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  45.95 
 
 		 938 aa  78.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  39.39 
 
 		 361 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  52.11 
 
 		 4106 aa  78.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  35.41 
 
 		 585 aa  78.2  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  45.37 
 
 		 460 aa  78.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 243 aa  77.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.38 
 
 		 980 aa  78.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  42.24 
 
 		 639 aa  78.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  34.05 
 
 		 2836 aa  77.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>