More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1619 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4067  hypothetical protein  44.64 
 
 		 1442 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.715218  normal  0.232276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  100 
 
 		 1202 aa  2395    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  44.7 
 
 		 1421 aa  214  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  52.94 
 
 		 1631 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  45.32 
 
 		 4723 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  37.05 
 
 		 1134 aa  122  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  43.78 
 
 		 221 aa  113  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  42.02 
 
 		 759 aa  113  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  42.94 
 
 		 2701 aa  109  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  46.36 
 
 		 677 aa  107  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  37.23 
 
 		 486 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  44.23 
 
 		 745 aa  100  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  41.06 
 
 		 768 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  37.82 
 
 		 621 aa  95.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  37.82 
 
 		 621 aa  95.1  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  39.34 
 
 		 1610 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  42.76 
 
 		 2133 aa  92  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  44.38 
 
 		 2097 aa  92  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  52.99 
 
 		 4231 aa  92  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  42.25 
 
 		 535 aa  91.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  36.04 
 
 		 1323 aa  90.9  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  40.61 
 
 		 648 aa  91.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  39.67 
 
 		 3391 aa  90.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  45.19 
 
 		 535 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  42.76 
 
 		 2198 aa  89.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  41.91 
 
 		 340 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  44.12 
 
 		 727 aa  89.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  43.84 
 
 		 1650 aa  87.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  50.48 
 
 		 4106 aa  85.1  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  43.94 
 
 		 1133 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  47.22 
 
 		 2704 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  46.3 
 
 		 1389 aa  84  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  45.28 
 
 		 417 aa  84  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4084  hypothetical protein  38.12 
 
 		 295 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.049689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  35.71 
 
 		 1610 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  34.72 
 
 		 3094 aa  83.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  39.42 
 
 		 2193 aa  82.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  53.68 
 
 		 2542 aa  82.4  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  52.22 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1699 aa  80.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  53.26 
 
 		 4678 aa  79.7  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  44.27 
 
 		 2467 aa  79  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27271  hypothetical protein  33.71 
 
 		 715 aa  78.2  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  52.17 
 
 		 5218 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  51.09 
 
 		 6753 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  53.19 
 
 		 303 aa  76.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.25 
 
 		 588 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.28 
 
 		 2346 aa  75.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  50 
 
 		 9030 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.52 
 
 		 1109 aa  75.5  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.35 
 
 		 1403 aa  75.5  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  37.1 
 
 		 2452 aa  75.5  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  44.44 
 
 		 1166 aa  75.5  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.98 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  38.76 
 
 		 1883 aa  75.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  38.3 
 
 		 3587 aa  74.7  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1111 aa  74.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  48.91 
 
 		 8682 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.74 
 
 		 5962 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  37.5 
 
 		 3608 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  34.76 
 
 		 998 aa  73.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  44.63 
 
 		 934 aa  73.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.11 
 
 		 998 aa  73.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  38.3 
 
 		 3587 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  44.12 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 2336 aa  72.4  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  43.64 
 
 		 1019 aa  72  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 		 491 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.55 
 
 		 2678 aa  72  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  51.28 
 
 		 7149 aa  72  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  36.72 
 
 		 2296 aa  71.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  42.2 
 
 		 3209 aa  71.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.05 
 
 		 1839 aa  71.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 1764 aa  71.6  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  30.58 
 
 		 480 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  40.34 
 
 		 16322 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 5787 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  54.22 
 
 		 448 aa  70.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.16 
 
 		 3314 aa  71.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  46.59 
 
 		 3184 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  62.5 
 
 		 1594 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  35.15 
 
 		 1779 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  48.11 
 
 		 375 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  47.57 
 
 		 313 aa  70.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1121 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.05 
 
 		 4220 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.35 
 
 		 1372 aa  70.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.25 
 
 		 2239 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  42.86 
 
 		 855 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  48.31 
 
 		 1055 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  42.27 
 
 		 4848 aa  70.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  54.84 
 
 		 709 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  47.95 
 
 		 4791 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  44.44 
 
 		 7679 aa  69.3  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  28.87 
 
 		 2784 aa  69.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  47.25 
 
 		 6662 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  49.02 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.25 
 
 		 6683 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  48.04 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.81 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>