74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4067 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4067  hypothetical protein  100 
 
 		 1442 aa  2844    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.715218  normal  0.232276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  44.64 
 
 		 1202 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.04 
 
 		 1712 aa  60.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.6 
 
 		 1236 aa  60.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40 
 
 		 2667 aa  60.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  37.76 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  56.9 
 
 		 467 aa  57.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 462 aa  57.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  37.39 
 
 		 2885 aa  55.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  48.53 
 
 		 2524 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  44.58 
 
 		 481 aa  54.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 		 219 aa  54.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.89 
 
 		 485 aa  53.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  41.07 
 
 		 1079 aa  53.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  34 
 
 		 475 aa  53.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  40.85 
 
 		 462 aa  52.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  38.39 
 
 		 476 aa  52.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  31.9 
 
 		 938 aa  52.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  49.18 
 
 		 260 aa  52  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  43.21 
 
 		 476 aa  52  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 465 aa  51.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  44.62 
 
 		 219 aa  50.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  42.65 
 
 		 2245 aa  50.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  33.33 
 
 		 486 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.4 
 
 		 2668 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.08 
 
 		 1390 aa  50.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  42.19 
 
 		 448 aa  50.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  29.33 
 
 		 1706 aa  50.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  41.3 
 
 		 460 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  41.98 
 
 		 475 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 		 202 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  48.28 
 
 		 202 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  36.23 
 
 		 726 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 608 aa  49.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  36.61 
 
 		 474 aa  48.9  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  38.53 
 
 		 475 aa  48.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  47.17 
 
 		 686 aa  48.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  45.9 
 
 		 559 aa  48.5  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  41.41 
 
 		 460 aa  48.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  32.65 
 
 		 480 aa  48.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3592  Hemolysin-type calcium-binding region  36.92 
 
 		 303 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0868117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  48.33 
 
 		 475 aa  47.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  40 
 
 		 513 aa  47.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  31.62 
 
 		 813 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 		 475 aa  47.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  52 
 
 		 907 aa  47.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.81 
 
 		 5962 aa  47.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.35 
 
 		 2105 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  42.19 
 
 		 681 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  37.38 
 
 		 491 aa  47.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  42.37 
 
 		 1502 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  35.71 
 
 		 1145 aa  47  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  31.82 
 
 		 504 aa  47  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  39.44 
 
 		 917 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  34.55 
 
 		 490 aa  46.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  37.5 
 
 		 2768 aa  47  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  46.67 
 
 		 2178 aa  47  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 1925 aa  46.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  46.67 
 
 		 475 aa  46.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  38 
 
 		 1164 aa  46.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  43.04 
 
 		 5218 aa  45.8  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  42.62 
 
 		 4798 aa  45.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.21 
 
 		 998 aa  45.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  35.83 
 
 		 497 aa  45.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  35.83 
 
 		 497 aa  45.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  43.64 
 
 		 1394 aa  45.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  27.59 
 
 		 1529 aa  45.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  37.86 
 
 		 3026 aa  45.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.53 
 
 		 980 aa  45.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  37.5 
 
 		 5442 aa  45.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  42.65 
 
 		 3209 aa  45.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  27.62 
 
 		 2954 aa  45.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4609  Hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 		 480 aa  45.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  32.87 
 
 		 759 aa  45.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>