More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4084 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4084  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.049689 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  39.39 
 
 		 648 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  36.6 
 
 		 677 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  38.12 
 
 		 1202 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  35.8 
 
 		 1883 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  37.27 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  32.94 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  37.27 
 
 		 621 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  31.65 
 
 		 759 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  37.99 
 
 		 486 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  36.48 
 
 		 745 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  44.53 
 
 		 1699 aa  72.8  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.42 
 
 		 1553 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.51 
 
 		 1610 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  39.18 
 
 		 1538 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  41.35 
 
 		 1166 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  38.51 
 
 		 1610 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  37.86 
 
 		 3229 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  32.39 
 
 		 4120 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.43 
 
 		 5839 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  33.33 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 		 5098 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35 
 
 		 5962 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.33 
 
 		 588 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  31.18 
 
 		 2133 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  31.18 
 
 		 2198 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  37.12 
 
 		 2704 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  34.48 
 
 		 682 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 		 1073 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  35.86 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  34.91 
 
 		 889 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  52.38 
 
 		 1712 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  31.14 
 
 		 2097 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.56 
 
 		 1372 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  30.38 
 
 		 768 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  32.89 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  35.17 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  40.62 
 
 		 5218 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  42.22 
 
 		 2542 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  49.35 
 
 		 2775 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.21 
 
 		 4836 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  30.34 
 
 		 1764 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  41.3 
 
 		 1055 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  40.43 
 
 		 998 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  49.32 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  42.11 
 
 		 998 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  39.45 
 
 		 4791 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  48.1 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  45.45 
 
 		 820 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  41.51 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  32.56 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.62 
 
 		 1197 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  39.13 
 
 		 709 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  40.38 
 
 		 4106 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.37 
 
 		 547 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.38 
 
 		 485 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  30.46 
 
 		 6753 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  47.56 
 
 		 786 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  28.26 
 
 		 8682 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  40.59 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  28.26 
 
 		 9030 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  39 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  46.51 
 
 		 4687 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.84 
 
 		 1839 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  41.51 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.55 
 
 		 1403 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  31.91 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  39.8 
 
 		 6662 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  38.89 
 
 		 4678 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.5 
 
 		 2701 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.62 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.8 
 
 		 6683 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  39.8 
 
 		 6779 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  29.3 
 
 		 851 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 1022 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 1017 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  39.8 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  27.17 
 
 		 998 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.11 
 
 		 1180 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.42 
 
 		 2346 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  46.34 
 
 		 817 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  40.18 
 
 		 856 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.8 
 
 		 2239 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  36.21 
 
 		 813 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.57 
 
 		 4220 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.46 
 
 		 3427 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.33 
 
 		 1963 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  33.97 
 
 		 387 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  35.51 
 
 		 709 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  50.79 
 
 		 686 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  33.57 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.62 
 
 		 2067 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  31.76 
 
 		 1133 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04541  hypothetical protein  45.45 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>