More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1560 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  44.02 
 
 		 3619 aa  1045    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  48.08 
 
 		 2342 aa  1154    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  40.4 
 
 		 1712 aa  849    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  44.02 
 
 		 3619 aa  1048    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  41.76 
 
 		 1625 aa  869    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  100 
 
 		 3094 aa  6128    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  44.83 
 
 		 1650 aa  1007    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  45.62 
 
 		 3608 aa  1057    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  57.14 
 
 		 2950 aa  1584    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  65.04 
 
 		 3587 aa  1274    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  65.05 
 
 		 3587 aa  1271    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  48.02 
 
 		 2342 aa  1148    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  32.1 
 
 		 741 aa  131  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 		 734 aa  128  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  33.68 
 
 		 769 aa  108  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  37.21 
 
 		 795 aa  100  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.24 
 
 		 946 aa  100  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.47 
 
 		 1279 aa  99.8  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.11 
 
 		 1883 aa  99.8  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  31.07 
 
 		 648 aa  99.4  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.74 
 
 		 980 aa  99.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.06 
 
 		 1795 aa  96.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.68 
 
 		 2954 aa  94.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.21 
 
 		 595 aa  94.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  32.52 
 
 		 460 aa  91.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  31.1 
 
 		 2133 aa  90.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.61 
 
 		 2678 aa  90.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  31.9 
 
 		 768 aa  90.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.77 
 
 		 1534 aa  89.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.8 
 
 		 2105 aa  89.4  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  35.34 
 
 		 1164 aa  88.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 		 1287 aa  89  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 		 744 aa  87.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  31.8 
 
 		 387 aa  87.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.64 
 
 		 2668 aa  87.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  42.15 
 
 		 232 aa  87  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  34.03 
 
 		 361 aa  86.7  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.1 
 
 		 2667 aa  86.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  32.11 
 
 		 2198 aa  86.3  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  30.84 
 
 		 2701 aa  86.3  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.27 
 
 		 1963 aa  85.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.67 
 
 		 3427 aa  85.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  33.99 
 
 		 1532 aa  85.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 		 615 aa  84.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  35.12 
 
 		 556 aa  84.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 		 260 aa  84.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 387 aa  84.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.89 
 
 		 1236 aa  84.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  34.7 
 
 		 767 aa  84.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  45.52 
 
 		 9867 aa  84.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  35.5 
 
 		 833 aa  84.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.85 
 
 		 1415 aa  84  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  34.98 
 
 		 357 aa  84  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  42.14 
 
 		 526 aa  84  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  33.05 
 
 		 709 aa  84  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  31.05 
 
 		 982 aa  84  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2936  peroxidase  26.9 
 
 		 714 aa  84  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  35.57 
 
 		 491 aa  84  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.79 
 
 		 1363 aa  83.2  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.05 
 
 		 4334 aa  83.2  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  34.72 
 
 		 1202 aa  83.2  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.91 
 
 		 686 aa  82.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  36.94 
 
 		 341 aa  82.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  34.76 
 
 		 728 aa  82.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 		 219 aa  82.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.68 
 
 		 485 aa  82.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.65 
 
 		 588 aa  82.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  34.36 
 
 		 1400 aa  82.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.82 
 
 		 2911 aa  82  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.91 
 
 		 5962 aa  81.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  33.95 
 
 		 361 aa  81.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  34.02 
 
 		 221 aa  81.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  33.95 
 
 		 361 aa  81.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  44.37 
 
 		 5769 aa  80.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  34.91 
 
 		 341 aa  80.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.97 
 
 		 3396 aa  80.5  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 		 206 aa  80.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  39.83 
 
 		 243 aa  80.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  27.76 
 
 		 745 aa  80.1  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.74 
 
 		 1016 aa  79.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.7 
 
 		 577 aa  79  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  44.07 
 
 		 245 aa  78.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  33.49 
 
 		 833 aa  78.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  34.11 
 
 		 739 aa  77.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.41 
 
 		 219 aa  77.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  29.09 
 
 		 759 aa  77.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  38.51 
 
 		 724 aa  77.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  30.08 
 
 		 460 aa  77.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  44.78 
 
 		 5218 aa  76.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  30.08 
 
 		 589 aa  76.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  30 
 
 		 736 aa  76.3  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.18 
 
 		 824 aa  76.3  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.22 
 
 		 1499 aa  76.3  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  27.53 
 
 		 1855 aa  76.3  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  32.84 
 
 		 257 aa  76.3  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  44.27 
 
 		 912 aa  76.3  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.58 
 
 		 2775 aa  75.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  33.11 
 
 		 4798 aa  75.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.12 
 
 		 2467 aa  75.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  35.2 
 
 		 1594 aa  75.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>